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草莓钙依赖蛋白激酶基因的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王萌 1 ; 王俊 1 ; 刘洪 2 ; 李静 2 ; 段可 2 ; 叶正文 3 ; 高清华 3 ;

作者机构: 1.宁夏大学生命科学学院

2.上海市农业科学院生物技术研究所

3.上海市农业科学院林木果树研究所

关键词: 久香草莓;CDPK基因;克隆;基因结构;进化树;RT-PCR

期刊名称: 西北植物学报

ISSN: 1000-4025

年卷期: 2011 年 31 卷 05 期

页码: 21-26

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以EST测序结合RACE技术,从久香草莓的茎尖中分离得到一个新基因,BLASTX分析显示这是一个钙依赖蛋白激酶编码基因,与GenBank中的FaCDPK1同源,命名为FaCDPK2,GenBank登录号为HQ829293.采用半定量RT-PCR对FaCDPK2基因在不同组织中的表达分析表明,FaCDPK2全长3 775 bp,读码框1 659bp,由12个外显子组成,编码552个氨基酸残基,在第89~349位是保守的蛋白激酶结构域,C端含4个EFhand钙结合域.该基因编码蛋白与拟南芥CPK28序列一致性为86.25%,与草莓FaCDPK1序列一致性为43.99%.表达分析显示该基因表达范围较广,在所分析的七种草莓组织材料中,以花中表达水平最高,在果实中的表达可能受成熟的诱导.

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