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萝卜硫苷生物合成相关基因RsFMO_(GS-OXs)的预测及分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王辉 1 ; 郭军 2 ; 梅燚 2 ; 祖艳侠 2 ; 吴永成 2 ; 郑佳秋 2 ;

作者机构： 1.青岛农业大学园艺学院

2.青岛农业大学园艺学院;江苏沿海地区农业科学研究所

关键词： 十字花科;萝卜;硫代葡萄糖苷;FMO GS-OX

期刊名称： 江西农业学报

ISSN： 1001-8581

年卷期： 2014 年 01 期

页码： 25-27+31

摘要： 以控制拟南芥硫苷生物合成相关基因家族FMO GS-OXs全长cds为参考序列,在萝卜ESTs数据库中进行blastn检索,得到具备Score≥100、E-value≤10-10和coverage≥70%条件的24条萝卜ESTs作为候选的拟南芥FMO GS-OXs基因的同源ESTs,并进行序列聚类拼接、注释及分析。结果显示:在萝卜中发现两个旁系同源基因(RsFMO GS-OXa和RsFMO GS-OXb)。RsFMO GS-OXs与拟南芥FMO GS-OXs间在核酸水平上的一致性为68.0%~83.2%;RsFMO GS-OXs旁系同源基因间的一致性仅为67.3%;RsFMO GS-OXs与白菜FMO GS-OXs同源基因间的一致性为67.3%~92.9%。系统进化分析发现,RsFMO GS-OXa和白菜FMO GS-OX2基因亲缘关系最近,而RsFMO GS-OXb和白菜FMO GS-OX5a亲缘关系更近一些,同时认为,RsFMO GS-OXa和RsFMO GS-OXb的直系同源基因分别为FMO GS-OX2和FMO GS-OX5。

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