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玉米1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶ITPK家族基因的鉴定和分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张中保 1 ; 李向龙 2 ; 吴忠义 3 ; 魏建华 2 ;

作者机构： 1.中国农业科学院作物科学研究所

2.北京农业生物技术研究中心

3.北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心

关键词： 玉米;三磷酸肌醇5/6激酶;保守结构域;表达模式

期刊名称： 科技导报

ISSN： 1000-7857

年卷期： 2015 年 33 卷 16 期

页码： 46-50

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶(ITPK)是一种在动物、植物、线虫中都比较保守的多功能酶,在生物信号传导及生长发育中起重要作用。为了充分研究玉米中ITPK家族基因系统分析、全生育期基因表达模式及逆境胁迫表达模式,利用玉米基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定玉米ITPK家族基因的全序列、定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。利用玉米高通量芯片表达数据进行组织表达差异性、干旱胁迫和病害胁迫表达谱分析。结果表明,玉米基因组中含有6个ITPK家族基因,分布于玉米的4条染色体上。MEME保守结构域分析显示,Zm ITPK1-5均含有3个保守的ATP-grasp-4结构域,Zm ITPK6含有两个ATP-grasp-4保守结构域。进化树分析表明Zm ITPK可分为3个亚家族。各个发育阶段中,多数成员在生殖器官或营养器官中均有较高的表达量,只有Zm ITPK1在所有器官中表达量都不高。Zm ITPK2和Zm ITPK3基因受干旱胁迫处理诱导不同程度上调表达。而在生物胁迫条件下均无显著上调或下调表达。

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