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利用SSR标记对新疆部分向日葵自交系材料进行群体结构划分及聚类分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘胜利 1 ; 段维 2 ; 王鹏 1 ; 柳延涛 1 ; 王沛政 3 ;

作者机构： 1.新疆农垦科学院作物研究所

2.新疆康地种业科技股份有限公司

3.海南热带海洋学院

关键词： 向日葵;序列标签位点;群体结构;聚类分析

期刊名称： 新疆农业科学

ISSN： 1001-4330

年卷期： 2017 年 54 卷 02 期

页码： 223-233

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】序列位置标签(Sequence Tagged Site,STS)为一段短的DNA序列,在其生物染色体上只出现一次,适宜于作为作物基因组的一种地标。【方法】研究随机选取向日葵500对序列标签位点SSR引物,利用其中62对具有多态SSR标记对136份新疆食葵和油葵自交系进行PCR多态扩增和筛选。【结果】62对序列标签位点SSR标记在136份向日葵中扩增表现稳定多态,占所选引物数量的12.4%,扩增产物条带清晰、稳定和易读。136份向日葵群体基因型依据△K的变化,可以分为2大类群。其中73份油葵自交系材料中,70%自交系材料被分配到第1大群,油葵资源材料主要归类在第1大群。30份油葵保持系中只有4份保持系被分配到第2大群,其余保持系均在第1大群。而在43份油葵恢复系中有25份分配到第1大群,其余分配到其它群中,表明油葵恢复系遗传多样性较为丰富。在55份食葵自交系中,仅有21%食葵被分到第1大群,食葵资源材料主要属于第2大群。【结论】食葵的遗传多样性较油葵的遗传多样性丰富,食葵和油葵资源材料间有部分基因相互交叉渗透,为新疆向日葵核心种质的构建和资源的合理利用提供理论支持。

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