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荔枝蒂蛀虫不同地理种群遗传多样性初步研究

文献类型： 中文期刊

作者： 郭义 1 ; 李鹏燕 1 ; 李敦松 1 ;

作者机构： 1.广东省农业科学院植物保护研究所/农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室/广东省植物保护新技术重点实验室

关键词： 荔枝蒂蛀虫;地理种群;遗传多样性;遗传分化;简化基因组测序;系统进化树

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2024 年 51 卷 009 期

页码： 119-128

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】明确荔枝蒂蛀虫(Conopomorpha sinensis Bradley)不同地理种群的遗传结构特征、遗传多样性水平及分子变异情况，为其起源和演化研究提供科学证据，为不同区域的荔枝蒂蛀虫防治提供参考信息。【方法】选用我国南方5个产区的荔枝蒂蛀虫为材料，利用GBS(Genotyping-by-sequencing)技术对样本进行基因分型，再利用SAMTOOLS软件鉴定单核苷酸多态性(SNP)位点，根据SNP基因分型结果构建系统进化树，并进行主成分分析。【结果】利用GBS技术对5个地区荔枝蒂蛀虫进行测序，共获得高质量有效数据27.39 Gb(平均每个样本5.48 Gb)、高质量SNP位点11 767个。系统进化树分析表明，四川泸州种群单独聚为一支，与其他4个种群亲缘关系较远。主成分分析结果显示，5个地区荔枝蒂蛀虫可划分为2个类群，四川泸州种群单独为一簇，明显区分于其他4个种群。主成分分析和系统进化树分析均表明不同地理来源的荔枝蒂蛀虫在遗传水平上存在明显差异。种群遗传多样性分析结果表明，5个种群观测杂合度(Ho)为0.2099～0.2531、期望杂合度(He)为0.1937～0.2203、核苷酸多样性(π)为0.2495～0.2748，表明5个荔枝蒂蛀虫种群的遗传多样性水平较低。AMOVA分析结果表明，荔枝蒂蛀虫种群间的遗传变异(0.87%)小于种群内(99.13%)，表明变异主要来源于种群内而不是种群间。【结论】不同地区的荔枝蒂蛀虫种群遗传多样性水平较低，其中，四川泸州种群遗传分化程度较高，与其他4个种群亲缘关系较远。

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