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藜麦WOX转录因子家族的鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 朱满喜 1 ; 杨雅舒 1 ; 杨小兰 1 ; 张芳 1 ; 杨利艳 1 ; 王创云 2 ;

作者机构： 1.山西师范大学生命科学学院

2.山西省农业科学院作物科学研究所

关键词： 藜麦;WOX转录因子;生物信息学;基因表达;氮胁迫

期刊名称： 湖南师范大学(自然科学学报)

ISSN： 1000-2537

年卷期： 2020 年 43 卷 004 期

页码： 43-49

收录情况： 北大核心

摘要： 为揭示藜麦WOX基因家族的功能,为藜麦耐低氮品种的培育提供参考,利用生物信息学方法,对藜麦WOX基因进行全基因组鉴定,并对其理化性质、系统发育、基因结构、保守结构域、保守基序、组织表达和响应氮胁迫的表达进行分析.研究结果表明:藜麦中共有13个WOX转录因子,蛋白长度159~676 aa,相对分子质量18510~76730,等电点5.27~9.56;每个成员含有1~4个内含子及2~5个外显子,WOX蛋白都具有由34~60个氨基酸组成的Homeobox保守结构域.系统进化树显示,来源于拟南芥、水稻和藜麦的39个WOX基因分为3组,每一组都含有3个物种的家族成员,同一个物种的WOX基因具有更近的遗传距离.组织表达热图显示,藜麦WOX基因组织表达特异性明显,在茎中的表达量最高,其次是种子和叶,在幼苗中的表达量最低.AUR62031363和AUR62035466对氮胁迫的响应最为显著.

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