文献类型： 中文期刊

作者： 向立刚 ¹ ; 蔡刘体 ¹ ; 李文红 ¹ ; 余知和 ¹ ; 汪汉成 ¹ ; 穆青 ¹ ;

作者机构： 1.长江大学农学院;贵州省烟草科学研究院;贵州省农业科学院植物保护研究所;长江大学生命科学学院;贵州省烟草公司黔西南州公司

关键词： 立枯丝核菌;融合群;基因组序列;基因功能;立枯病;烟草

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2023 年 06 期

页码： 1027-1037

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)AG-1 IB融合群是重要的土传病原真菌，可引起烟草苗期立枯病。本研究通过Illumina HiSeq PE 150和Oxford Nanopore PromethION测序平台获得了分离自发病烟草植株的R.solani AG-1 IB LK4菌株的全基因组序列。结果表明，该基因组全长45.9 Mbp,包含112个重叠群。重叠群的N50为0.89 Mbp, GC含量为52.13%。基因组共线性分析结果显示，LK4与其他4个已公开发布基因组序列的R.solani AG-1 IB菌株相比，易位和易位+反转现象更为常见，表明LK4菌株在基因组结构上具有独特性。LK4基因组中共预测到7,978个蛋白编码基因，231个非编码基因以及5,191个重复序列。NR、GO、KEGG、Swiss-Prot、COG、PHI、Signal P、CAZy、DFVF、TCDB和P450数据库被用于蛋白编码基因的分类与注释，其中有7,375个蛋白编码基因至少被上述数据库注释过一次。该基因组的组装和注释对进一步揭示立枯丝核菌的致病机理以及烟草立枯病的防控研究具有重要意义。