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橡胶树生殖发育相关基因的RNA-Seq转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 位明明 1 ; 王亚杰 2 ; 李维国 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室

2.海南大学农学院中国热带农业科学院橡胶研究所

3.中国热带农业科学院橡胶研究所国家橡胶树育种中心

关键词： 橡胶树;生殖发育;RNA-Seq;GO分析;代谢通路分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2017 年 14 卷 01 期

页码： 99-106

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了揭示橡胶树生殖发育相关基因的表达变化情况,本研究以橡胶树热研7-33-97花序、雄蕊、雌蕊为试验材料,利用Illumina HiSeq~(TM) 2000对早期发育的花序、雄蕊及雌蕊进行RNA-Seq测序,共识别出30 164个长度大于200 bp的Unigenes,与其它物种的序列相似性进行比较,发现所得Unigenes与麻疯树的Unigenes相似数量最多。进一步对测序所得Unigenes进行GO(Gene ontology)功能注释和Pathway显著性富集分析发现这些Unigenes能够编码相应的993种酶(Enzyme,EC),参与了197条生物学通路(pathway),相关Unigenes主要涉及碳水化合物运输与代谢、膜转运代谢以及能量代谢通路,由此推测碳水化合物合成与运输相关基因可能在橡胶树生殖发育过程中起重要调控作用。本研究通过对橡胶树花器官发育相关基因进行转录水平分析,为深入开展橡胶树生殖发育相关功能基因的克隆和功能验证提供了丰富的基因资源,并为揭示橡胶树生殖发育的分子调控机制奠定良好基础。

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