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类芽孢杆菌对携带NDM基因的超级耐药大肠杆菌的抑菌活性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李海利 1 ; 杨帆 2 ; 陈建豪 2 ; 杨康 2 ; 杨夷平 2 ; 段进刚 2 ; 李斌 2 ; 张婉琪 2 ; 马春江 2 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院畜牧研究所

2.新疆哈密市动物疫病预防控制中心

关键词: 类芽孢杆菌;连翘;内生菌;饲用微生物;抑菌效果;大肠杆菌;超级耐药

期刊名称: 中国农业科技导报(中英文)

ISSN: 1008-0864

年卷期: 2025 年 27 卷 008 期

页码: 119-131

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为筛选对同时携带新德里金属β-内酰胺酶(New Delhi metal-β-lactamase,NDM)基因NDM1/NDM5和NDM4/NDM5的超级耐药大肠杆菌抑菌活性较好的药用植物内生菌,采用表面消毒法和平板对峙法分离筛选对同时携带NDM1/NDM5和NDM4/NDM5的超级耐药大肠杆菌有拮抗作用的连翘内生菌,通过形态学和分子生物学鉴定,并结合全基因组学分析探究其抗菌活性物质。结果表明,从连翘根、茎、叶和果中分离得到23株内生菌。采用平板对峙法抑菌试验,从23株内生菌中获得1株抗菌效果较好的革兰氏阳性内生菌HNYJ2209J,经形态学鉴定和分子鉴定为类芽孢杆菌(Paenibacillus sp),该菌能有效抑制超级耐药大肠杆菌的活性。对HNYJ2209J菌株进行全基因组测序分析,其基因组大小为5 827 342 bp,GC含量为46.22%,预测其编码基因为5 232个,其中被NR、Swiss-Prot、COG、GO、KEGG数据库注释的基因数分别为5 229、3 648、4 107、3 493和2 495。通过antiSMASH预测到8个与次级代谢产物合成相关的基因簇;主要次级代谢产物有环脂肽类抗生素、十三肽菌素、多粘菌素B、抗菌肽、噻唑环肽类化合物、拉索肽、脂质庚肽和多烯聚酮类化合物。其中,脂肽类抗生素、十三肽菌素、多粘菌素B和抗菌肽的预测合成基因簇与已知基因簇的同源性分别为100%、100%、100%和90%。综上表明,HNYJ2209J菌株具有开发针对同时携带NDM1/NDM5和NDM4/NDM5超级耐药大肠杆菌的新药和作为可饲用微生物的潜力。

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