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橡胶树SAM-SSR体系的优化

文献类型： 中文期刊

作者： 于飞 1 ; 冯素萍 1 ; 童和林 1 ; 武耀廷 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带牛物技术研究所

2.琼州大学

关键词： 橡胶树;SAM-SSR;优化

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2009 年 25 卷 13 期

页码： 241-245

收录情况： 北大核心

摘要： 以橡胶树品种热研88-13为试材,研究了橡胶树SAM-SSR法中各个过程(酶切、连接、抑制性和预扩增)中各因素对SAM法结果的影响。实验结果表明:5UMseⅠ和5UPstⅠ双酶切1h为最合适酶切浓度、方式和时间;100～300ng为适宜的DNA模板浓度;合适的连接温度和时间为16℃连接过夜;连接产物和抑制性PCR产物分别稀释20倍,为抑制性PCR和预扩增PCR的适宜模板浓度。SAM扩增产物用8%的非变性聚丙烯酰胺凝胶检测,结果显示,扩增条带分布在200～750bp之间,能够满足建立橡胶树SSR基因组文库的需要。

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