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谷子基因组SSR信息分析和标记开发

文献类型: 中文期刊

作者: 张晗* 1 ; 王雪梅* 1 ; 王东建 1 ; 孙加梅 1 ; 杨延兵 1 ; 段丽丽 1 ; 李华 1 ; 宋国安 1 ; 王晓宇 2 ; 李汝玉 1 ;

作者机构: 1.山东省农业科学院作物研究所

2.山西省农业科学院谷子研究所

关键词: 谷子;基因组序列;SSR;多态性

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2013 年 11 卷 01 期

页码: 30-36

收录情况: CSCD

摘要: 对从Phytozome数据库中获取的谷子基因组序列进行搜索,在21150.78kb序列中发现2872个SSR,平均每7.36kb就有一个SSR;共发现126种重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸类型分别占63.41%和31.86%。初步设计了74对SSR引物,其中64对引物可以稳定扩增。利用40对引物对27份谷子品种进行多态性检验,27对引物扩增良好且多态性丰富,共扩增出220个等位变异,平均每个位点8.15个。

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