文献类型： 中文期刊

作者： 何杰丽 ¹ ; 薛延桃 ¹ ; 王瑞云 ¹ ; 陈国荣 ¹ ; 陈凌 ¹ ; 王海岗 ¹ ; 杨美红 ¹ ; 乔治军 ¹ ;

作者机构： 1.山西农业大学文理学院;山西农业大学农学院;山西省农业科学院农作物品种资源研究所/农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室

关键词： 糜子;Ty1-copia;序列特征;基因表达

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 22-28

摘要： [目的]发掘抗旱相关基因,明晰其编码蛋白的理化特征,为糜子育种提供基因元件。[方法]利用生物信息学软件、数据库和在线程序,对糜子Ty1-copia型反转录转座子编码蛋白进行生物信息学分析,同时对该基因进行qRTPCR表达特性分析。[结果]Ty1-copia基因编码蛋白分子式为C483H758N122O135S7,分子量为10 658.49Da,呈弱碱性,是不稳定的疏水蛋白;该蛋白为非分泌型蛋白、无跨膜结构,既不存在于叶绿体上也不存在于线粒体上;二级结构包括4个α螺旋,4个β折叠;三级结构包括1个螺旋结构和2个折叠结构;含4个保守结构域;系统进化树和多重序列比对结果显示糜子保守性较低,与水稻类和毛竹的同源性为64%。实时定量PCR检测结果表明,Ty1-copia表达水平在干旱胁迫处理不同时间点存在显著差异,3h时表达量最高,为对照的2.02倍;8h时该基因呈下调表达,表达量低于对照。[结论]Ty1-copia基因可以由干旱胁迫诱导。