您好，欢迎访问湖北省农业科学院 机构知识库！
湖北省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

禽巴氏杆菌链霉素耐药株转录组测序与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 汪最 1 ; 孔令严 1 ; 邵华斌 1 ; 卢琴 1 ; 罗青平 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所;长江大学动物科学学院;农业部畜禽细菌病防治制剂创制重点实验室

关键词： 禽源多杀性巴氏杆菌;转录组测序;GO功能分析;KEGG功能分析;ARDB分析

期刊名称： 中国预防兽医学报

ISSN： 1008-0589

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 288-293

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为鉴定禽源多杀性巴氏杆菌(Pm)链霉素(Str)敏感株与耐药株(MIC=1024μg/mL)在转录组水平上的差异,本研究采用RNA-seq技术对Str敏感株与耐药株进行双向测序,筛选得到差异表达基因,通过GO、KEGG和ARDB数据库对差异表达基因进行分组和富集性分析,并利用荧光定量PCR对筛选出的差异表达基因进行验证。结果显示,共筛选获得625个差异表达基因,其中包括581个上调基因和44个下调基因。通过GO功能富集分析显示差异表达基因多数发挥细胞膜转运功能;对差异表达基因进行信号通路富集性分析显示,大多数差异表达基因分布在ABC转运蛋白与双组分系统代谢途径中;采用ARDB对差异表达基因进行耐药基因分析,显示其中的耐药基因主要为氨基糖苷转移酶类和外排系统两类。本研究结果表明,禽源Pm对Str的耐药机制可能与细胞膜上多药外排泵的过量表达和氨基糖苷转移酶类灭活抗菌药物有关。同时,也为进一步研究禽源Pm对Str的耐药机制奠定了基础。

  • 相关文献

[1]禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株转录组测序与分析. 孔令严,罗青平,卢琴,邵华斌,李槿年. 2017

[2]禽巴氏杆菌四环素耐药株转录组测序与分析. 孔令严,汪最,邵华斌,张腾飞,卢琴,罗青平. 2019

[3]体外诱导禽巴氏杆菌链霉素耐药株及耐药机制的初步分析. 汪最,孔令严,邵华斌,卢琴,罗青平,杨玉莹. 2018

[4]体外诱导禽巴氏杆菌环丙沙星耐药株及耐药机制的初步分析. 孔令严,李槿年,卢琴,邵华斌,罗青平. 2017

[5]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽. 2018

[6]基于盐胁迫转录组信息的蚕豆F-box基因家族分析. 郝树琳,陈宏伟,廖芳丽,李莉,刘昌燕,刘良军,万正煌,沙爱华. 2020

[7]基于RNA-seq技术的茶树CsbHLH62生物信息学分析. 曹丹,金孝芳,马林龙,刘艳丽,郭桂义. 2019

[8]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024

[9]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019

[10]80份绿豆象抗感蚕豆种质资源SSR遗传多样性分析. 孙虎,刘昌燕,李莉,刘良军,韩雪松,万正煌,沙爱华,陈宏伟. 2023

[11]鸡EGFR基因的功能分析及其对颗粒细胞中基因表达的影响研究. 陈林,王家乡,吴艳,皮劲松,蒲跃进. 2025

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：湖北省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台