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锈色棕榈象气味结合蛋白的同源建模

文献类型： 中文期刊

作者： 阎伟 1 ; 骆有庆 1 ; 李朝绪 1 ; 刘丽 1 ; 覃伟权 1 ; 彭正强 1 ;

作者机构： 1.北京林业大学林木有害生物防治北京市重点实验室;中国热带农业科学院椰子研究所;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

关键词： 气味结合蛋白;同源模建;三维结构;锈色棕榈象

期刊名称： 应用昆虫学报

ISSN： 2095-1353

年卷期： 2017 年 54 卷 06 期

页码： 909-914

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】锈色棕榈象Rhynchophorus ferrugineus为危害棕榈科植物的重要入侵害虫,为获得该害虫气味结合蛋白(Odorant binding protein,OBP)的三维结构,从而基于计算反向化学生态学方法筛选潜在对该害虫行为具有调控作用的挥发物用于防控奠定基础。【方法】以蛋白质数据库中已经报道的昆虫OBP晶体结构为模板,采用同源建模方法构建获得了该害虫2个OBP的三维结构。模建结构通过Procheck、Verify_3D和ERRAT进行评价,得到的评估分值均表明模建结构质量高。【结果】三维模建结构显示,这2个锈色棕榈象OBP由6个α-螺旋和连接这些螺旋的回折构成,6个半胱氨酸形成的3对二硫键起到了稳定结构的作用。【结论】模建结构的获得,为今后通过分子对接筛选潜在的活性挥发物用于防控锈色棕榈象奠定了基础。

  • 相关文献

[1]我国锈色棕榈象遗传多样性及遗传结构分析. 肖雨倩,黄梦伊,阎伟,石娟. 2023

[2]三维MXene多孔结构的构建与应用研究进展. 吕可,张吉振,孔娜,周吉,陶金龙. 2022

[3]橡胶HMGR蛋白的生物信息学分析与同源模建. 吴春太,李维国,高新生,张晓飞. 2009

[4]腰果角盲蝽气味结合蛋白基因HtheOBP3的克隆及组织表达分析. 张绍华,孟倩倩,刘爱勤,颜日辉,林先武,孙世伟,李付鹏,王政. 2023

[5]昆虫嗅觉相关蛋白的研究进展. 王晓双,唐良德,吴建辉. 2017

[6]瓜实蝇气味结合蛋白基因的克隆及表达谱分析. 张亚楠,龚治,牛黎明,符悦冠. 2018

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