文献类型： 中文期刊
作者： 徐文 1 ; 安素妨 1 ; 王艳 1 ; 贾琳琳 1 ; 鲁丹丹 1 ; 张莹莹 1 ; 刘建丰 1 ; 李保全 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院作物设计中心;河南省农业科学院农业经济与信息研究所
关键词： 甘蓝型油菜;转录组测序;新转录本;RNA-seq
期刊名称： 河南农业科学
ISSN： 1004-3268
年卷期： 2018 年 04 期
页码： 38-42
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了鉴定甘蓝型油菜基因组中新的未知转录本,以甘蓝型油菜叶片为材料提取总RNA,构建c DNA文库并使用Illumina双端测序Hiseq 2500平台进行测序。用生物信息学的方法分析高质量的测序reads来鉴定新的未知转录本。结果表明,在甘蓝型油菜基因组已知基因的间隔区共鉴定到7 720个候选新转录本,通过RT-PCR和克隆测序验证了15个新鉴定的转录本。
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