文献类型： 中文期刊
作者： 徐文 1 ; 安素妨 1 ; 王艳 1 ; 贾琳琳 1 ; 鲁丹丹 1 ; 张莹莹 1 ; 刘建丰 1 ; 李保全 1 ;
作者机构： 1.河南省农业科学院作物设计中心;河南省农业科学院农业经济与信息研究所
关键词： 甘蓝型油菜;转录组测序;新转录本;RNA-seq
期刊名称： 河南农业科学
ISSN： 1004-3268
年卷期： 2018 年 04 期
页码： 38-42
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了鉴定甘蓝型油菜基因组中新的未知转录本,以甘蓝型油菜叶片为材料提取总RNA,构建c DNA文库并使用Illumina双端测序Hiseq 2500平台进行测序。用生物信息学的方法分析高质量的测序reads来鉴定新的未知转录本。结果表明,在甘蓝型油菜基因组已知基因的间隔区共鉴定到7 720个候选新转录本,通过RT-PCR和克隆测序验证了15个新鉴定的转录本。
- 相关文献
[1]利用RNA-Seq发掘玉米叶片形态建成相关的调控基因. 郭书磊,鲁晓民,齐建双,魏良明,张新,韩小花,岳润清,王振华,铁双贵,陈彦惠. 2020
[2]基于RNA-seq的谷子萌芽期抗旱相关基因挖掘与分析. 代小冬,朱灿灿,宋迎辉,王春义,代书桃,秦娜,李君霞. 2021
[3]去势对淮南公猪背最长肌转录组的影响. 王璟,滑留帅,陈俊峰,张家庆,任巧玲,白红杰,郭红霞,徐照学,邢宝松,白献晓,曹海. 2019
[4]芝麻发育转录组分析. 魏利斌,苗红梅,张海洋. 2012
[5]玉米自交系响应花粒期高温胁迫差异表达基因的分析. 李川,乔江方,朱卫红,代书桃,黄璐,张美微,刘京宝. 2019
[6]Transcriptome profile of liver at different physiological stages reveals potential mode for lipid metabolism in laying hens. Li, Hong,Wang, Taian,Xu, Chunlin,Wang, Dandan,Ren, Junxiao,Li, Yanmin,Tian, Yadong,Wang, Yanbin,Jiao, Yuping,Kang, Xiangtao,Liu, Xiaojun,Tian, Yadong,Wang, Yanbin,Kang, Xiangtao,Liu, Xiaojun,Kang, Xiangtao,Liu, Xiaojun,Jiao, Yuping. 2015
[7]Genome-wide identification and functional prediction of novel and fungi-responsive lincRNAs in Triticum aestivum. Zhang, Hong,Hu, Weiguo,Hao, Jilei,Lv, Shikai,Wang, Changyou,Tong, Wei,Wang, Yajuan,Wang, Yanzhen,Liu, Xinlun,Ji, Wanquan,Hu, Weiguo. 2016
[8]双油8号不同结实部位种子品质差异. 朱家成,张书芬,曹金华,王建平,文雁成,何俊平,赵磊. 2013
[9]甘蓝型油菜F<,2:3>家系重要农艺性状及品质的相关和通径分析. 张书芬,傅廷栋,马朝芝,朱家成,王建平. 2004
[10]甘蓝型油菜杂种后代芥酸含量及含油量的表现及其杂种优势分析. 张书芬,华中农业大学植物科学与技术学院,马朝芝,朱家成,王建平,傅廷栋. 2005
[11]甘蓝型油菜胞质雄性不育系两种配合力的表现及相关性分析. 田保明,张书芬,王建平,文雁成,朱家成,刘建明,任乐建. 2002
[12]不同甘蓝型油菜品种(系)抗寒性分析. 曹金华,张书芬,朱家成,王建平,文雁成,赵磊,何俊平. 2013
[13]两种甘蓝型油菜化杀制种方法对比试验. 宋放,王谧,宋淑琦,陈杰. 2016
[14]甘蓝型油菜双低萝卜质不育恢复系快速改良技术研究. 文雁成,张书芬,王建平,朱家成,何俊平,蔡东芳,曹金华,赵磊,王东国. 2016
[15]高含油量油菜品系T057-7选育方法研究. 朱家成,张书芬,文雁成,王建平,赵磊,王军亮,刘改. 2009
[16]高含油量油菜杂交种双油092的选育及保优高产栽培技术. 朱家成,张书芬,王建平,雁成,张书法,赵磊,曹金华,何俊平,蔡东芳. 2016
[17]甘蓝型油菜雄性不育细胞质遗传效应研究. 张书芬,宋文光,田保明,任乐见,李好海. 1995
[18]甘蓝型单、双低油菜细胞质雄性不育杂种的抗逆性研究. 张书芬,傅廷栋,宋文光. 1993
[19]河南省甘蓝型油菜细胞质雄性不育杂种优势研究应用及展望. 张书芬,朱家成,王建平,文雁成,张书法,何俊平,曹金华,蔡东芳,赵磊,王东国,隋天显. 2018
[20]MITE转座子在不同甘蓝型油菜品种中的多态性研究. 安素妨,李保全,鲁丹丹,李高原,侯锦娜. 2019
作者其他论文 更多>>
-
艾草种质资源农艺性状的综合评价
作者：许兰杰;余永亮;梁慧珍;杨青;李磊;安素妨;谭政委;董兵
关键词：艾草;种质资源;农艺性状;综合评价
-
红花农艺性状与SCoT标记的关联分析
作者：许兰杰;梁慧珍;余永亮;安素妨;杨青;李春明;董薇;李磊;王红雨
关键词：红花;农艺性状;SCoT标记;关联分析
-
全基因组水平金银花TCP基因家族的鉴定及表达模式分析
作者：谭政委;郭水柱;苏小雨;孙瑶;余永亮;李磊;张利超;许兰杰;鲁丹丹;安素妨;李春明;梁慧珍;王子君
关键词：金银花;TCP转录因子;基因家族;共线性分析;系统进化;表达模式
-
红花CtWRKY7和CtWRKY72基因的克隆及功能分析
作者：鲁丹丹;苏小雨;谭政委;余永亮;李磊;许兰杰;杨青;梁慧珍
关键词：红花;WRKY;表达模式;花发育;逆境胁迫
-
基于表型和DNA分子标记的菊花种质研究进展
作者：许兰杰;余永亮;杨红旗;谭政委;杨青;安素妨;董薇;李磊;鲁丹丹;梁慧珍
关键词：红花;表型;DNA分子标记;标记辅助选择(MAS)
-
基于高密度遗传图谱的玉米雄穗分枝数QTL定位
作者：张莹莹;张君;孙海潮;张盼;董文恒;李永江;史丽丽;卢道文;张凤启;庞文喜
关键词：玉米;雄穗分枝数;重组自交系;QTL定位
-
蒲公英应用实践及药理作用研究进展
作者：安素妨;余永亮;董薇;苏小雨;许兰杰;梁慧珍
关键词：蒲公英;临床应用;扁桃体炎;乳腺炎;药理作用;抗炎
