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越橘SSR反应体系的优化

文献类型: 会议论文

第一作者: 崔建民

作者: 崔建民 1 ; 杨忠 2 ; 邹荣仟 1 ; 李亚东 1 ; 温景辉 3 ; 赵爽 4 ;

作者机构: 1.吉林农业大学园艺学院,长春,130118

2.吉林省产品质量监督检验院,长春,130022

3.吉林省农业科学院果树研究所,长春,130033

4.长春工业大学电气与电子工程学院,长春,130012

关键词: 越橘;SSR反应体系;优化筛选;退火温度;PCR扩增;亲缘关系

会议名称: 中国园艺学会小浆果分会第二届学术研讨会

主办单位: 中国园艺学会

页码: 506-511

摘要: 以"美登"、"北春"、"蓝丰"为试材,用TIANGEN植物基因组试剂盒提取基因组DNA,对SSR反应体系中的Mg2+浓度、dNTPs浓度、TaqDNA聚合酶用量、引物浓度、DNA模板浓度以及引物CA344F的退火温度进行了优化筛选,探讨了越橘SSR技术中PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响.确定了适合越橘的SSR反应体系:在20μL反应体系中,Mg2+2.0 mmol/L,dNTPs 0.20 mmol/L,TaqDNA聚合酶0.5 U,引物浓度0.8μmol/L,DNA模板1.5ng/μL;引物CA344F的最佳退火温度为58℃。利用此反应体系对部分越橘品种进行PCR扩增并用6%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,扩增结果清晰且DNA谱带多态性丰富,表明该体系稳定可靠,适合越橘的亲缘关系分析.

分类号: S663.9`Q78

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