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用于荔枝qPCR分析的内参基因克隆及稳定性分析

文献类型: 会议论文

第一作者: 魏永赞

作者: 魏永赞 1 ; 赖彪 2 ; 胡福初 3 ; 李晓静 2 ; 胡桂兵 2 ; 王惠聪 4 ;

作者机构: 1.华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室,广东广州 510642 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,广东湛江 524091

2.华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室,广东广州 510642

3.华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室,广东广州 510642 海南省农业科学院热带果树研究所,海南海口 571100

4.华南农业大学园艺学院南方果树生理研究室,广东广州 5106

关键词: 荔枝;荧光实时定量PCR分析;内参基因;基因表达;稳定性分析

会议名称: 第三届全国果树分子生物学学术研讨会

主办单位: 中国园艺学会

页码: 159-165

摘要: 要获得真实可信的qPCR结果,必须选择合适的内参基因。利用基因克隆和测序,本实验从“妃子笑”荔枝果皮中获得了β-Actin、GAPDH和18SrRNA 3个qPCR分析常用的内参基因全长序列,其长度分别为1273bP、1368bP和1712bp;3个基因与其它物种高度同源,氨基酸序列同源性均超过了98%。在此基础上,结合已报道的UBQ、eEF和25S rRNA 3个常用的内参基因,对β-Actin、GAPDH、18Sr RAN、UBQ、eEF和25SrRNA6个常用内参基因在荔枝果实发育不同阶段和外源生长调节剂处理后表达稳定性进行了分析,同时比较了geNorm、NormFinder和BestKeeper三种不同算法的差异。结果表明:以上6个基因中,β-Actin在三种不同算法下均保持了较好的表达稳定性。

分类号: S667.1

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