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半滑舌鳎鳗弧菌感染前后的免疫相关组织转录组分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 沙珍霞

作者： 沙珍霞 1 ; 章翔 2 ; 丁少雄 2 ; 陈松林 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋渔业可持续发展重点实验室,260071,山东青岛

2.厦门大学海洋学院,福建厦门

关键词： 半滑舌鳎;鳗弧菌感染;高通量测序;基因表达;转录组分析

会议名称： 中国海洋湖沼学会、中国动物学会鱼类学分会2012年学术研讨会

主办单位： 中国海洋湖沼学会;中国动物学会

页码： 144-145

摘要： 在转录组水平上研究半滑舌鳎在感染鳗弧菌前后的免疫响应将有助于更深刻的理解鱼类的分子免疫机制,同时也为抗病品种培育提供参考.本文应用Illumina的RNA-Seq技术对感染前后半滑舌鳎免疫相关组织进行了高通量测序，除去接头、低质量序列之后，采用拼接软件Trinity对所得序列进行de-nov组装，初步的表达差异基因分析显示，部分免疫相关基因出现了表达量差异。通过对感染鳗弧菌前后半滑舌鳎免疫相关组织转录组的从头组装与功能注释，获得了大量相关的转录本信息，可以用于进一步用于表达谱与比较转录组分析。

分类号： S941.42

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