文献类型： 会议论文
第一作者：
作者： 陈松林 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所水产基因组与细胞工程研究室
关键词： 半滑舌鳎;基因表达;连锁图谱;分子机制
会议名称： 第七次全国动物生物技术学术研讨会暨新疆畜牧科学院第六次学术年会
主办单位： 中国农业生物技术学会
页码： 26-26
摘要： 本文利用新一代测序技术完成了半滑舌蝎全基因组测序。基因组大小约为520Mb。采用3种基因预测方法预测半滑舌蝎基因数量为20,834，平均每个基因的编码区长度为1,535bp，平均每个基因含有9个外显子。采用新一代RAD-seq技术构建了半滑舌蝎高密度SNP遗传连锁图谱。父本和母本测序深度分别为16.8X和15.1X，基因组覆盖度达到92.8%和94.9%，筛选获得拟测交SNP位点894,373个，其中父本杂合位点407,084，母本杂合位点397,300，双亲杂合位点89,989，基因组覆盖度分别达到96.2%、96.4%和95.3%。对F1群体216个子代进行RAD测序，测序深度为0.4X。利用两个亲本全基因组重测序SNP信息以及F1群体后代216个个体的RAD-tag信息，从而得到后代个体的基因型数据，选择其中的3528个标记，构建了半滑舌蝎SNP高密度遗传连锁图谱，LOD阂值为10，构建了22个连锁群(常染色体20个，性染色体2个)，平均每个连锁群含有160个标记，标记间平均距离为0.568cM覆盖基因组422Mb。利用高密度遗传连锁图谱构建了半滑丙塌染色体基因组图谱。采用BAC克隆构建了半滑舌蝎物理图谱，将30294个BAC克隆组装成1485个Contig，其平均大小达到537kb.从W染色体序列上筛选到一些雌性特异基因，采用FISH技术将这些雌性特异基因定位在W染色体上，同时进行了这些雌性基因在不同组织和不同发育时期的表达分析、重组表达及其表达产物注射后对半滑舌蝎鱼苗性别相关基因的影响。
分类号： Q959.486.03
- 相关文献
[1]半滑舌鳎髓样分化因子的克隆和表达分析. 沙珍霞,王娜,王启龙,徐田军,王磊,董晓丽,陈松林. 2010
[2]半滑舌鳎RasGRP3基因的克隆和免疫应答分析. 陈学杰,陈亚东,于孟君,孙璐明,杨光,沙珍霞. 2016
[3]半滑舌鳎AKT-ineracting protein基因的克隆及免疫应答表达分析. 孙璐明,于孟君,陈亚东,陈学杰,刘洋,仇雪梅,沙珍霞. 2016
[4]半滑舌鳎骨形态发生蛋白4基因的克隆和表达分析. 马骞,冯文荣,柳淑芳,庄志猛,马慧. 2016
[5]半滑舌鳎鳗弧菌感染前后的免疫相关组织转录组分析. 沙珍霞,章翔,丁少雄,陈松林. 2012
[6]鲤EST标记与耐低温性状的相关性分析及定位. 常玉梅,高国强,徐丽华,刘金亮,刘春雷,梁利群. 2010
[7]镜鲤体质量和体长的QTL定位研究. 郑先虎,曹顶臣,匡友谊,张晓峰,鲁翠云,李超,孙效文. 2012
[8]鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用. 张鹏,杨官品,张立楠,危起伟,邹桂伟. 2011
[9]鲢AFLP和微卫星标记连锁图谱构建. 张立楠,邹桂伟,危起伟,杨官品. 2010
[10]鲢序列已知标记连锁图构建及鲢-草鱼标记共线性分析. 杨静,张鹏,危起伟,邹桂伟,杨官品. 2012
[11]染色体研究的新方法与新进展. 龙华,付元帅,陈戟,赵刚,刘江东,陈建武,余其兴. 2006
[12]一种杂交鲤四种经济性状的QTL定位分析. 吕伟华,匡友谊,郑先虎,曹顶臣,李超,鲁翠云,孙效文. 2013
[13]河鲀毒素及其在河鲀体内积累研究进展. 张瀚元,李卫东,张海恩,刘英杰. 2023
[14]延迟投饵对半滑舌鳎仔鱼生长、存活和体成分的影响. 常青,陈四清,马静,梁萌青,郑珂珂. 2011
[15]胜利原油对半滑舌鳎肝脏超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活性的影响. 夏斌,陈碧鹃,李传慧,崔毅,马绍赛. 2011
[16]不同饲料对半滑舌鳎摄食、生长及饲料利用的比较研究. 贾磊,刘皓,陈京华,王彦怀,宋文平. 2010
[17]半滑舌鳎生长相关基因的微卫星及其在种群遗传结构分析中的应用. 马骞,林琳,柳淑芳,钟声平,庄志猛,苏永全,唐启升. 2012
[18]悬浮物对半滑舌鳎胚胎和初孵仔鱼的毒性效应. 周勇,马绍赛,曲克明,陈聚法,徐勇. 2009
[19]半滑舌鳎IRF-7基因的全长cDNA克隆及表达分析. 刘万建,史成银,宋展,耿伟光,李赟,黄倢. 2012
[20]促性腺激素调控半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)卵母细胞孕酮受体膜组分1的表达特征. 张金勇,柳学周,史宝,徐永江. 2017
作者其他论文 更多>>
-
东星斑人工繁育与养殖技术(中)
作者：梁友;陈松林;毛东亮;曾顺辉;李昶昊;李建海
关键词：
-
豹纹鳃棘鲈抗哈维氏弧菌遗传参数分析
作者：瞿诗雨;卢昇;陈松林;刘洋;周茜;王磊;徐文腾;宋煜
关键词：遗传参数;遗传力;豹纹鳃棘鲈;哈维氏弧菌
-
东星斑人工繁育与养殖技术(上)
作者：梁友;陈松林;毛东亮;曾顺辉;李昶昊;李建海
关键词：
-
半滑舌鳎响应急性高温胁迫的生理变化和相关基因表达
作者：王润;刘洋;杨英明;王婧;张婷婷;林梦娇;王磊;陈松林
关键词：半滑舌鳎;急性高温胁迫;肝脏;细胞凋亡;抗氧化酶;热休克蛋白基因
-
胆汁酸调节鱼类糖脂代谢、免疫及肠道菌群的研究进展
作者：周茜;张俊炜;王升鹏;李超伟;陈松林
关键词：胆汁酸;糖脂代谢;免疫调控;肠道菌群;鱼类养殖
-
斑石鲷irf3基因鉴定及其在虹彩病毒感染下的表达模式
作者：李开敏;王磊;巩志宏;王清滨;李华;杨桂文;黄友华;陈松林
关键词：斑石鲷;irf3;基因表达;siRNA
-
牙鲆rnd1基因克隆、表达模式及与抗病力的关系
作者：张子威;王磊;李开敏;卢昇;郑卫卫;陈松林
关键词：牙鲆;rnd1;迟缓爱德华氏菌;抗病免疫;抑菌活性
