文献类型： 会议论文
第一作者： Liu Bo
作者： Liu Bo 1 ; 刘波 2 ; Hu Gui-ping 1 ; 胡桂萍 2 ;
作者机构： 1.Institute of Applied Ecology,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China
2.福建省农业科学院农业生物资源研究所,福建省 福州市,350003
关键词： 芽孢杆菌;平均核苷酸同源性;全基因组;数据分析
会议名称： 第五届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运作服务研讨会
主办单位： 中国微生物学会
页码： 3-16
摘要： 采用Jspecies软件分析芽孢杆菌全基因组之间平均核苷酸同源性(ANI)的特征性.结果表明,芽孢杆菌属间,种间及亚种间两两菌株间ANI与其分类地位相关,具有明显属种特异性,其中芽孢杆菌科不同属之间的ANI值分布于50％-65％;芽孢杆菌种间ANI值均低于95％,分布范围为65％到90％,加权平均数为70.12％,其中90％的ANI值低于70％;芽孢杆菌亚种间ANI值分布主要范围为90％到96％,占90％.这样,芽胞杆菌属间的ANI鉴定标准建议定为50-65％,芽胞杆菌种间的ANI鉴定标准建议定为65-90％,芽胞杆菌亚种间的ANI鉴定标准建议定为90-96％.同时,基因组中的四核苷酸(Tetra)回归系数与ANI值具有相关性,表现明显属种特征性,回归拟合显示两者呈现一元二次方程关系,y=271-573.56x+399.65x2(R2=0.9812),同时高于70的ANI值与相应的Tetra回归系数呈线性正相关,方程式为y=178.58x-81.521 (R2=0.8767).试图通过芽胞杆菌全基因组的测序,建立以ANI为基础的芽胞杆菌种类鉴定系统.
分类号： Q939.124
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