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基于转录组数据的大菱鲆(Scophthalmus maximus)功能基因SNP

文献类型： 会议论文

第一作者： 王婷

作者： 王婷 1 ; 黄智慧 2 ; 马爱军 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室农业部海洋渔业可持续发展重点实验室,山东青岛266071

2.大连海洋大学116023

关键词： 大菱鲆;功能基因;单核苷酸多态性;转录组数据

会议名称： 中国高端养鱼模式构建与可持续发展论坛

主办单位： 中国工程院农业学部

页码： 35-35

摘要： 本研究基于大菱虾雌雄转录组测序数据，选择其中45个SNP位点，设计引物63组，其中21(46.7%)个位点应用小片段高分辨率熔解曲线(HRM)技术分型成功。对其进行多态性检测，21个位点均具有二个单倍型。观测杂合度H。的分布范围为0.256到1.000，期望杂合度H。的范围从为0.276到0.518,19个位点符合Hardy-Weinberg平衡。14个SNP位点位于基因编码区，其中3个属于非同义突变。含有这些SNP位点的基因大多与信号转导和转录翻译相关。本研究表明，高通量转录组测序和小片段HRM适合大规模SNP标记开发，为大菱虾的分子遗传育种提供了候选标记资源。

分类号： S965.399:S961

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