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小麦红吸浆虫唾腺EST序列的生物信息学分析

文献类型： 会议论文

第一作者： 段云

作者： 段云 1 ; 武予清 1 ; 蒋月丽 1 ; 苗进 1 ; 吴仁海 1 ;

作者机构： 1.河南省农业科学院植物保护研究所 河南省农作物病虫害防治重点实验室,郑州450002

关键词： 小麦;红吸浆虫;唾腺结构;表达序列标签;生物信息学

会议名称： 中国植物保护学会2010年学术年会

主办单位： 中国植物保护学会

页码： 240-247

摘要： 利用生物信息学方法,对GeneBank中收录的全部来源于小麦红吸浆虫唾腺的1 217条表达序列标签(EST)进行综合分析.分析内容包括:序列的前处理、聚类和拼接、ORF预测、基因注释及功能分类、序列的同源性分析和SSR查找与分析等.结果表明,共得到1 195条高质量的EST序列、1 047条unigenes(总长度为492.9Mbp)、785个ORF(开放阅读框)和214条SSR序列.通过注释分析发现了一些与细胞色素氧化酶、细胞色素P450、NADH氧化还原酶、热激蛋白、分子伴侣、免疫相关蛋白和信息素/气味结合蛋白等同源的具有重要生物学意义的EST序列.

分类号： S435.122.1

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