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基于转录组测序的蝴蝶兰微卫星特征分析

文献类型: 会议论文

第一作者: XIAO Wen-fang

作者: XIAO Wen-fang 1 ; 肖文芳 2 ; LI Zuo 3 ; 李佐 4 ;

作者机构: 1.Environmental Horticulture Research Institude of Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou 510640

2.Guangdong Provincial Key Laboratory of Ornamental Plant Germplasm Innovation and Utilization, Guangzhou 510640

3.广东省农业科学院环境园艺研究所,广州510640

4.广东省园

关键词: 蝴蝶兰;微卫星特征;长度变化;转录组

会议名称: 2015年中国观赏园艺学术研讨会

主办单位: 中国园艺学会

页码: 00000108-00000111

摘要: 以蝴蝶兰品种'满天红'及其花色突变体的花苞和花瓣为研究材料,利用Illumina HiSeqTM2000测序平台进行高通量测序,并进行SSR位点搜索,结果搜索到SSR的序列共6289条,得到7077个SSR,其中有694条序列不止含一个SSR.微卫星序列主要以二碱基重复单元为主,占总数的50.4%,其次为三碱基重复单元,占39.3%.在所有重复类型中,最主要的优势重复单元为AG/CT,占所有类型的31.8%,其次为AT/AT,占所有类型的12.9%.分析发现,蝴蝶兰微卫星长度变化与重复单元长度呈负相关(p<0.05),相关系数为-0.759.本研究通过高通量测序获得了大量的蝴蝶兰转录组信息,为今后蝴蝶兰的分子标记和基因组研究的发展提供一定的理论基础.

分类号: S682.31:S601

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