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贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性位点生物信息学分析

文献类型： 会议论文

第一作者： LAN Qing-Kuo

作者： LAN Qing-Kuo 1 ; 兰青阔 1 ; CHEN Rui 1 ; 陈锐 1 ; ZHAO Xin 2 ; 赵新 2 ; WANG Cheng 1 ; 王成 1 ; CHEN Xiao-Yun 1 ; 陈笑芸 3 ;

作者机构： 1.天津市农业质量标准与检测技术研究所,天津 300381

2.浙江省农业科学院农产品质量标准研究所 310021

3.天津

关键词： 贝母属药用植物;叶绿体基因组;单核苷酸多态性位点;生物信息学分析

会议名称： 第二届京津冀农产品质量安全青年论坛

主办单位： 京津冀农产品质量安全联合实验室`北京农产品质量安全学会

页码： 00004527-00004533

摘要： 目的：分析贝母属药用植物叶绿体基因组单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的分布特点、鉴别能力和应用价值,为中药材贝母精准鉴定方法的建立提供技术支撑. 方法：应用多重序列比对、SNP筛选、酶切位点分析等生物信息学分析手段,对贝母属6种药用植物的15条叶绿体基因组序列进行分析. 结果：贝母属叶绿体基因组DNA同源性达98.38％,通过分析共发现SNP位点4058个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,瓦布贝母鉴别候选位点个25个,太白贝母鉴别候选位点个120个,浙贝母鉴别候选位点个79个,湖北贝母鉴别候选位点个61个,平贝母鉴别候选位点794个. 结论：叶绿体基因组SNP分子标记因其密度高、鉴别力强和便于分析的特点,具有较大的应用价值.

分类号： S567.231.03

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