您好，欢迎访问江苏省农业科学院 机构知识库！
江苏省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

海滨雀稗自交结实突变体及野生型幼穗组织的转录组分析

文献类型： 会议论文

第一作者： QIAN Chen

作者： QIAN Chen 1 ; 钱晨 2 ; LIU Zhi-wei 1 ; 刘智微 2 ; ZHONG Xiao-xian 1 ; 钟小仙 2 ; WU Juan-zi 1 ; 吴娟子 2 ; ZHANG Jian-li 1 ; 张建丽 3 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院畜牧研究所,江苏 南京 210014

2.农业部种养结合重点实验室,江苏 南京 210014

3.农业部种养结合重点实验

关键词： 海滨雀稗;自交结实突变体;野生型幼穗组织;转录组测序

会议名称： 江苏省畜牧兽医学会首届“青年科技论坛”

主办单位： 江苏省畜牧兽医学会

页码： 00000536-00000547

摘要： 二倍体海滨雀稗Adalayd作为自交不亲和的暖季型草坪草,在环境保护及修复上发挥着重要的作用,但由于自身自交不亲和性减缓了其大面积推广.至今海滨雀稗自交不亲和的机制尚且未知并且基因数据库资源十分匮乏.为了研究海滨雀稗自交不亲和的机制,以二倍体海滨雀稗自交亲和体细胞突变体SP2008-3和自交不亲和野生型Adalayd为材料,采用Illumina Hiseq2000高通量测序技术进行转录组测序.获得2个材料幼穗组织的表达谱,共获得68175654个Raw reads片段,测序结果de novo拼接获得117619个单基因簇(Unigene),其中50％的Unigene被注释.比较两个基因表达谱,发现1303个差异表达基因并对这些差异基因进行了基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分类,筛选出了22个与植物自交不亲和反应相关的基因,其中14个钙离子信号通路(钙调素、钙依赖蛋白激酶、类钙调素互做蛋白激酶)、3个F-box和5个硫氧还蛋白-h(Thioredoxin-h)基因在体细胞突变体SP2008-3和野生型Adalayd之间存在差异表达,测序结果获得了很多与海滨雀稗自交不亲和相关的遗传资源信息.本研究首次将转录组学研究应用于海滨雀稗自交不亲和的研究,为海滨雀稗自交不亲和进一步研究提供了宝贵且有价值的基因信息基础.

分类号： S688.4:S603.2

  • 相关文献

[1]3种除草剂与肥料混施对海滨雀稗及交播黑麦草生长的影响. 张兆松,薛光,王永强. 2011

[2]海滨雀稗液泡膜H~+-PPase(PvVP1)5′端的克隆和序列分析. 南志标,蔡小宁,钟小仙,顾洪如. 2014

[3]基于高通量测序的海滨雀稗转录组学研究. 贾新平,叶晓青,梁丽建,邓衍明,孙晓波,佘建明. 2014

[4]海盐胁迫对海滨雀稗生长及植株体内阳离子含量的影响. 邹轶,顾洪如,钟小仙,丁成龙,沈益新. 2009

[5]海滨雀稗EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发. 李华勇,王显生,王艳平,吴燕,沈奇,贾新平. 2016

[6]盐胁迫对海滨雀稗生长和生理特性的影响. 贾新平,邓衍明,孙晓波,梁丽建. 2015

[7]杂草抗药性研究的最新进展. 杨霞. 2015

[8]大麦白化颖壳突变体的转录组学分析. 栾海业,臧慧,沈会权,张英虎,乔海龙,陶红,申玉香,陈和. 2017

[9]转录组测序分析猪胚胎附植的中期和后期卵巢差异表达基因. 付言峰,李兰,赵为民,方晓敏,李碧侠,王学敏,周李生,任守文. 2018

[10]转录组测序分析毒死蜱与醚菊酯混配对二化螟毒杀的增效机制. 徐鹿,罗光华,金瑜剑,徐德进,徐广春,顾中言. 2021

[11]魏可葡萄气生根发育的转录组分析. 葛金涛,王江英,赵文静,邵小斌,朱朋波,汤雪燕,孙明伟,刘兴满. 2020

[12]低氮处理对玉米早期发育胚乳中氨基酸水平和转录组的影响. 潘玉昕,赵涵,宁丽华. 2024

[13]不同蛋白含量大豆籽粒的转录组分析及蛋白合成相关基因预测. 张黎杰,刘书华,周玲玲. 2022

[14]嫁接砧木对西瓜枯萎病的抗病机理研究(摘要). 张曼,羊杏平,徐锦华,刘广,姚协丰,李苹芳. 2014

[15]斑点叉尾鮰伪雌鱼卵巢发育评估及比较转录组研究. 徐思琪,张世勇,王明华,刘洪岩,钟立强,陈校辉. 2024

[16]甘薯块根响应长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata)侵染的转录组测序分析. 杨冬静,马居奎,唐伟,陈晶伟,高方园,张成玲,孙厚俊,谢逸萍. 2022

[17]MSTN基因编辑湖羊胫腓肌的转录组分析. 李隐侠,刘伟佳,张晨俭,舒嘉傲,桂红兵,王慧利,孟春花,张俊,张建丽,钱勇,曹少先. 2024

[18]基于RNA-seq的甘薯芽变株系类胡萝卜素基因代谢差异分析. 赵冬兰,赵凌霄,刘洋,张安,戴习彬,周志林,曹清河. 2023

[19]基因差异表达分析方法及其在作物遗传育种中的应用. 苏在兴,高闰飞,李强. 2017

[20]梅山猪胚胎附植期EphB2的组织表达及RNA-seq分析. 付言峰,周艳红,王爱国,李兰,刘红林,李碧侠,任守文. 2014

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：江苏省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台