科研产出
鹅副粘病毒HZ株F蛋白基因的克隆及序列分析
《畜牧与兽医 》 2005 北大核心
摘要：以鹅副粘病毒HZ株的基因组RNA为模板,采用RT-PCR技术扩增出F基因片段,然后将其克隆到pUCm-T载体中。经转化、筛选、酶切和PCR鉴定后,初步获得含鹅副粘病毒F基因的阳性克隆,并进行序列测定验证。结果表明,该基因由1 662个核苷酸组成,共编码553个氨基酸。与GenBank下载的9株参考毒株的F基因作同源性比较,发现HZ株与ZJ1、F48E9、Lasota等毒株的核苷酸同源性分别为98.3%、85.4%、82.7%;氨基酸同源性分别为97.8%、90.6%、88.1%。说明HZ株与经典的鸡新城疫病毒(NDV)在F基因上存在很大的差异,而与近年来的分离株亲缘关系较近。
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猪圆环病毒Ⅱ型结构蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位预测
《中国预防兽医学报 》 2005 北大核心 CSCD
摘要：本研究以猪圆环病毒(PORCINE CIRCOVIRUS,PCV)Ⅱ型的基因组序列为材料,采用GAMIER-ROBSON方法、CHOU-FARPLUS 方法和KARPLUS-SCHULZ方法预测了其结构蛋白的二级结构,用KYTE-DOOLITTLE方法对结构蛋白的亲水性进行了分析,用EMINI方法预测了结构蛋白的表面可能性,以JAMESON-WOLF方法预测了蛋白的抗原指数.然后综合评价了PCV-2型结构蛋白的B细胞抗原表位.结果表明,PCV-2结构蛋白形成α螺旋结构的能力较差,但是该蛋白含有较多的β折叠和转角结构,因而该蛋白具有丰富的二级结构.分析结果还表明结构蛋白具有多处抗原指数较高的区段,其中羧基端含有潜在的B细胞优势抗原表位,因此其在免疫学中的地位也应当引起重视.本研究将为猪圆环病毒的反向疫苗学的研究提供一定的理论依据.
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