科研产出
基于重测序的不同生态型油梨的全基因组变异及进化分析
《热带农业科学 》 2022
摘要:为揭示不同生态型油梨间的差异,对4份不同生态型油梨进行全基因组重测序,平均测序深度为26×,平均覆盖度为89.39%。通过与参考基因组比对,4份不同生态型油梨平均杂合率为64.26%。除了西印度群岛生态型油梨品种Donnie的杂合率最低(为35.34%)外,剩下3份油梨品种的杂合率均超过70%。单核苷酸多态位点(SNP)数量为3 854 384~6 290 629个,小片段插入与缺失(Small InDel)总数为1 432 406~1 707 608个,这些突变导致了13 864~18 143个基因的变异。KEGG分析表明,淀粉和蔗糖的代谢通路在4份不同生态型油梨中均存在最多的变异基因。聚类分析表明,相对于西印度群岛生态型,危地马拉和墨西哥生态型油梨品种亲缘关系更近。研究结果在一定程度上反映了不同生态型油梨在基因组水平的差异,为分子标记辅助选择育种提供了科学依据。
关键词: 油梨 生态型 全基因组重测序 单核苷酸多态位点 亲缘关系
全文链接
请求原文
气候变暖背景下农作物空间格局重构研究
《中国农村科技 》 2022
摘要:全球气候变暖已经是一个不争的事实,气候变化问题已经成为21世纪各国可持续发展中面临的重大课题。政府间气候变化专门委员会(IPCC)第六次评估报告第一工作组的报告《气候变化2021:自然科学基础》指出,目前全球地表平均温度较工业化前高出约1℃。在考虑所有排放情景下,至少到本世纪中叶,全球地表温度将继续升高。除非在未来几十年内大幅减少二氧化碳和其他温室气体排放,否则21世纪将升温1.5℃或2℃。
全文链接
请求原文
不同木薯叶营养成分对饲养木薯蚕的影响
《南方农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:[目的]结合营养成分揭示不同木薯叶饲养对木薯蚕生长发育及其蚕丝纤维形态结构的影响,筛选出适宜饲养木薯蚕的木薯品种,为木薯叶饲用化提供参考依据.[方法]选用华南9号(SC9)木薯、花叶木薯、无叶柄木薯和紫叶木薯4种不同基因型木薯叶作为研究材料,以蓖麻叶为对照,分别测定叶片的可溶性糖、粗蛋白、干物率、氢氰酸、总类胡萝卜素、花青素、总黄酮等营养指标,统计经不同叶片饲养后木薯蚕五龄幼虫的体长、体重、蛹重及全茧重,并运用扫描电子显微镜观察蚕丝的形态结构.[结果]4种木薯叶的总类胡萝卜素含量、花青素含量、干物率和氢氰酸含量均高于蓖麻叶,其中紫叶木薯叶的花青素含量、总黄酮含量、干物率和氢氰酸含量显著高于其他4份材料(P<0.05,下同).相关分析结果显示,胡萝卜素与叶绿素、总类胡萝卜素与胡萝卜素、总黄酮与花青素、可溶性糖与氢氰酸呈极显著相关(P<0.01);主成分分析发现前2个主成分的累计贡献率为87.632%,其中,第一主成分主要由干物率、叶绿素和可溶性糖决定,第二主成分主要由叶黄素和粗蛋白决定.不同基因型木薯叶饲养对木薯蚕生长发育影响显著,可显著促进木薯蚕体长增长,其中,SC9木薯叶和紫叶木薯叶饲养的木薯蚕全茧重高于蓖麻叶饲养的木薯蚕,紫叶木薯叶饲养的木薯蚕蛹重最重,结茧率高.4种基因型木薯叶饲养获得的木薯蚕丝较蓖麻叶饲养获得的木薯蚕丝宽度有所增加,其中,紫叶木薯饲养获得的蚕丝宽度最宽,且木薯蚕丝表面较完整.[结论]蓖麻叶与4种基因型木薯叶的营养成分差异显著,木薯叶饲养可显著促进木薯蚕体增长.紫叶木薯饲养的木薯蚕蛹最重、结茧率高,且蚕丝表面较完整;SC9木薯叶饲养的木薯蚕重、体长及全茧重均最高,但其饲养获得的木薯蚕丝杂质较多.可见,紫叶木薯叶作为木薯蚕饲料来源具有较大的开发潜力.
全文链接
请求原文
木薯MeVINV1基因的CRISPR/Cas9基因编辑载体构建及验证
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:液泡转化酶(vacuolar invertase,VINV)是参与植物蔗糖代谢、器官发育的关键酶之一.木薯MeVINV1在块根发育及淀粉积累阶段的表达活跃,对该基因进行编辑敲除,将有助于解析MeVINVl在木薯块根淀粉积累过程中的作用.本研究构建了 MeVINV1的CRISPR/Cas9基因编辑载体,转化木薯脆性胚性愈伤组织以验证载体的编辑效果.结果发现:转化后的样品中,MeVINV1基因靶点位置出现测序多峰,而未转化样品中没有多峰出现,表明本研究构建的基因编辑载体可对MeVINV1基因进行编辑;检测分析潜在脱靶位点的序列,发现未出现脱靶现象.该研究为获得MeVINV1基因的突变体,明确其在木薯块根发育及淀粉积累过程中的功能奠定了基础.
关键词: 木薯(Manihot esculenta Crantz);液泡转化酶;MeVINV1;CRISPR/Cas9;脱靶效应
全文链接
请求原文
3种圭亚那柱花草根系分泌物对杂草幼苗生长的影响
《草地学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:为明确3种圭亚那柱花草(Stylosanthes guianensis Sw.)('热研2号'、'热研5号'和热研21号)的根系分泌物对杂草生长的化感效应,采用营养液培法分别收集其根系分泌物,研究其对5种外来入侵杂草幼苗形态特征及生物量分配的影响.结果表明,除对含羞草(Mimosa pudica L.)幼苗无显著影响外,3种圭亚那柱花草对其余4种杂草的总化感综合效应均为抑制作用.'热研5号'柱花草对杂草幼苗生长的化感抑制效应强于其他二者,对蒺藜草(Cenchrus echinatus L.)幼苗的根长、株高、地下生物量、地上生物量、总生物量和根冠比均有显著抑制效应(P<0.05),对羽芒菊(Tridax procumbens L.)幼苗的侧根数、地下生物量和根冠比有显著抑制效应(P<0.05),也显著抑制假臭草(Eupatorium catarium V.)幼苗的生物量向地下分配(P<0.05),仅对鬼针草(Bidens pilosa L.)幼苗的抑制效应相对较弱.灰色关联分析表明,进行圭亚那柱花草的化感效应研究中应重点关注总生物量、地上生物量和株高.由此推测,3种圭亚那柱花草品种中,'热研5号'柱花草具有防控外来入侵杂草的潜力.
关键词: 根系分泌物 外来入侵杂草 形态特征 生物量分配 化感抑制效应
全文链接
请求原文
橡胶树1981'IRRDB野生种质预割诱导次生乳管分化的比较分析
《热带作物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:巴西橡胶树树干树皮中的次生乳管是天然橡胶合成和贮存的主要组织,次生乳管列的多少与胶乳产量密切正相关.割胶是天然橡胶生产中的核心环节,是当前获得天然橡胶的唯一途径,而割胶伤害能诱导次生乳管分化.采用碘-溴染色方法和石蜡切片技术,观察预割前后1981'IRRDB野生种质成龄树的树皮结构,对不同种质预割前后黄皮层和水囊皮区域的乳管列进行统计,并分析新分化的次生乳管列.研究结果表明,选取的85份8年生野生种质在自然条件下的乳管分化能力普遍较弱,黄皮层和水囊皮中成列的次生乳管数量均较少,2个部位合计乳管列数普遍低于8列.预割后不同种质水囊皮中次生乳管列数普遍增多,但黄皮层尚无明显变化.根据伤害诱导分化新的次生乳管列数的多少,将预割诱导乳管分化的能力由低到高分为1、2、3级,分别对应于新分化乳管列数为少于2列、2~3列(含2列)、3~4列(含3列).在85份种质中,对应1级57份、2级23份、3级5份的种质,所占比例分别为67.06%、27.06%、5.88%,可见,诱导分化次生乳管能力强的种质占比较低,大部分种质为1、2级乳管分化,3级分化能力的种质极少.被诱导新分化次生乳管的能力与种质在自然条件下的分化能力有关,尤其是高乳管分化能力的种质通常在自然条件下也有较强的分化乳管的能力.通过预割判断乳管分化能力不仅为野生种质鉴定和评价奠定基础,也为橡胶树高产育种以及早熟、晚熟品种的早期预测提供有效指标.
关键词: 橡胶树;野生种质;预割;次生乳管分化
全文链接
请求原文
菠萝叶纤维增强热塑性淀粉复合材料的性能研究
《复合材料科学与工程 》 2022 北大核心
摘要:为深入研究天然纤维增强热塑性淀粉复合材料的性能,以双醛淀粉为原料,甘油为塑化剂,利用菠萝叶纤维作为增强材料,采用热压成型法制备菠萝叶纤维增强热塑性淀粉复合材料。研究了不同尺寸的菠萝叶纤维对复合材料力学性能、密度、含水率、降解性能的影响,并通过扫描电镜观察复合材料的表面和断面形貌。结果表明:加入菠萝叶纤维能有效提高复合材料的力学性能。随着菠萝叶纤维尺寸的减小,复合材料的力学性能呈现出逐渐增加再减小的趋势,当纤维尺寸为0.6 mm时,拉伸强度达到最大值7.18 MPa。当纤维尺寸>0.6 mm时,弯曲强度最佳,为13.79 MPa。随着菠萝叶纤维尺寸的减小,复合材料的密度呈现逐渐增大的趋势,含水率呈总体下降的趋势。在短期降解时间内,复合材料的失重率在常规及酵母菌两种土壤环境下呈现出随着纤维尺寸减小而逐渐减小的趋势,随着时间的延长,失重率逐渐趋向一致。
关键词: 菠萝叶纤维 热塑性淀粉 复合材料 力学性能 降解性能
全文链接
请求原文
玉米泛素连接酶U-box基因家族的全基因组鉴定及表达分析
《西南农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:[目的]U-box基因家族广泛存在于植物基因组中,能够编码泛素蛋白酶体系中特异性识别底物的泛素E3连接酶,调控蛋白的修饰和降解,对玉米的生长发育及逆境胁迫应答调控中起着重要作用,因此鉴定玉米U-box基因家族成员及进行基因功能研究具有重要意义.[方法]通过玉米全基因组数据库,利用一系列生物信息学工具对玉米U-box基因家族成员进行鉴定和功能分析.[结果]玉米U-box基因家族共鉴定筛选出76个成员,在玉米全基因组1~10号染色体上均有分布,氨基酸数目大小为94~1353 aa,蛋白等电点数值差距较大,从4.86到8.29不等.基因结构分析结果显示各成员间含有内含子数目不等,其中玉米U-box家族76个成员中共有28个基因无内含子,仅含有1个外显子,占玉米U-box基因总数的36.8%,表明这些基因进化可能源于转座子机制.系统进化分析结果显示水稻、拟南芥、玉米U-box基因分布在亚家族Ⅰ~Ⅸ中,其中亚家族Ⅳ中不含水稻、拟南芥U-box成员,仅含有2个玉米基因ZmPUB41和ZmPUB53,暗示了玉米在历史进化过程中在发生了多次家族基因扩增的同时也经过片段快速变异过程.启动子功能预测分析发现玉米U-box基因在玉米光合作用、植物激素应答以及逆境胁迫等方面发挥相应作用.基因组织表达分析显示玉米U-box基因表达特异性明显,主要在种子的组成型器官中表达,暗示了 目标基因可能参与了种子的形成或萌发过程.部分基因如ZmPUB12、ZmPUB18、ZmPUB30、ZmPUB40、ZmPUB75仅在花粉中检测出有表达量,说明其可能参与了玉米花粉粒的形成或受精过程.[结论]玉米U-box基因在玉米的光合作用、生长发育以及逆境胁迫应答等生理活动中发挥了重要作用,为后续对玉米U-box基因功能、蛋白代谢和信号转导等重要调控网络研究提供了理论基础.
关键词: 玉米;泛素U-box基因家族;生物信息学;启动子功能分析;基因表达
全文链接
请求原文
UPLC-Q-TOF-MS/MS分析海南竹叶蒲桃的化学成分(英文)
《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences 》 2022 CSCD
摘要:竹叶蒲桃是海南岛特有的植物资源,目前关于它化学成分的研究报道很少。本研究采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间串联质谱联用技术(UPLC-Q-TOF-MS/MS)鉴定竹叶蒲桃叶片中的主要化学成分。通过高分辨质谱数据分析、参考文献数据及对照品确认,对竹叶蒲桃的化学成分进行快速的定性分析,鉴定并推断出包括有机酸、酚酸、黄酮和香豆素在内的20种化合物,并对其裂解规律进行分析。其中4个有机酸、8个酚酸、7个黄酮和1个香豆素类化合物首次在竹叶蒲桃叶片中报道。本研究建立的方法能快速、准确地对竹叶蒲桃叶片中部分成分进行鉴定解析,为竹叶蒲桃植物资源的成分研究和开发利用提供了实验依据。
关键词: 竹叶蒲桃 UPLC-Q-TOF-MS/MS 鉴定
全文链接
请求原文


