科研产出
患铁虾综合征罗氏沼虾眼柄转录组研究
《渔业科学进展 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探索罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)铁虾综合征(IPS)的分子机制,采用高通量测序平台(Illumina Hiseq-2500)分别对患IPS罗氏沼虾(IPS虾)和正常罗氏沼虾开展转录组测序,进行生物信息学分析.结果显示,高通量测序共获得56.42 G高质量数据,拼接后得到221 901条单基因序列(unigene),长度范围为201~30 985 bp,平均长度为1572 bp,N50长度为2867 bp,N90长度为646 bp.将单基因序列分别在Nr、Nt、Swissprot、KEGG、KOG、GO、PFAM数据库进行序列比对及功能注释,103 570条得到注释,其中,GO数据库注释到的单基因序列最多.差异表达分析显示,2003个基因在IPS虾眼柄中差异表达,包括1209个上调基因和794个下调基因,516个基因被注释到242条KEGG通路中,翻译、信号转导和免疫系统富集的差异基因数目最多.催乳素、雌激素、胰岛素、促性腺激素释放激素、胰高血糖素、催产素、谷氨酸能突触、血清素能突触等与生殖调控相关激素的代谢过程在IPS虾与正常虾眼柄之间存在差异.此外,一些已被证明在免疫反应中起重要作用的基因在IPS虾眼柄中显著上调,如血管内皮生长因子受体1、丝氨酸蛋白酶抑制剂6、C型凝集素、芳基硫酸酯酶B、酚氧化酶原激活酶2a、组织蛋白酶B、组织蛋白酶L、甲壳类抗菌肽4等.同时,注释到溶酶体、吞噬体、抗原处理与呈递、细胞凋亡、内吞作用等多条与免疫相关的途径,支持近期研究得出的罗氏沼虾IPS与病原感染相关的结论.本研究为解析罗氏沼虾IPS的成因和分子机制提供了数据支撑.
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尼罗罗非鱼traf6基因表达谱及信号转导
《水生生物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)是一种重要的接头蛋白,在Toll样受体/白细胞介素-1受体(TLR/IL-1R)超家族所触发的信号通路中起重要作用,与先天性免疫密切相关.文章研究了尼罗罗非鱼(Oreo-chromis niloticus)traf6的表达模式和初步的功能.在健康鱼中,traf6转录本广泛表达于所有受检组织中,在血液中表达水平最高,在肝脏中最低.在不同的胚胎发育阶段也检测到traf6的表达.在无乳链球菌体内感染后,大多数受检组织中traf6 mRNA的表达量上调.此外,LPS、Poly I:C和S.agalactiae可显著诱导尼罗罗非鱼巨噬细胞traf6的表达.此外,在HEK293T细胞中过表达表明,TRAF6分布于细胞质中,可显著提高NF-κB的活性.免疫共沉淀(Co-IP)实验表明,TRAF6可与IRAK1(白细胞介素-1受体相关激酶1)相互作用,IRAK1在TLR/IL-1R信号通路中也起重要作用.在体内,TLR2、TLR21和TLR13b的过表达可上调traf6 mRNA的表达水平,表明TRAF6参与了TLR2、TLR21和TLR13b介导的信号转导,提示TRAF6在病原体入侵的免疫应答中起重要作用.
关键词： 尼罗罗非鱼;肿瘤坏死因子受体相关因子6;表达谱;免疫反应;NF-κB活性;信号转导
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基于LBB方法估算北部湾竹■鱼种群参数
《上海海洋大学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为探究北部湾竹■鱼（Trachurus japonicus）不同组距的划分对其种群参数和资源评估的影响,利用2006—2018年北部湾竹鱼叉长数据重构长度频率,通过逻辑斯蒂曲线拟合和长度贝叶斯生物量估算（length-based Bayesian biomass estimation method, LBB）方法,估算竹■鱼的初次性成熟叉长(L50)、渐进叉长（L∞）、相对自然死亡率（M/k）、相对捕捞死亡率（F/k）、相对总死亡率（Z/k）、最适开捕叉长(Lcopt)、开发率（E）和相对生物量（B/B0）等种群参数。分析在不同组距情况下种群参数的差异。结果表明:初次性成熟叉长范围为157～162 mm;北部湾竹■鱼种群参数平均值分别为L∞=248 mm、M/k=1.38、F/k=6.92、Z/k=8.28和Lcopt=156 mm;北部湾竹■鱼相对生物量B/B0低于0.5,E大于0.5;不同组距重构长度频率估算的种群参数结果有差异,且随组距的增大波动较为明显。研究表明,竹■鱼生物量相对低且处于过度开发状态,建议今后以样本数量、长度组成和生物特性共同确定某种鱼类长度分组组距。
关键词： 竹■鱼 北部湾 组距 长度贝叶斯生物量估算法 长度频率 种群参数
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南极大磷虾共附生细菌多样性及其防御功能研究
《海洋渔业 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为研究南极大磷虾(Euphausia superba)中共附生微生物的功能性,并探讨南极大磷虾与其相关微生物的相互作用关系,采用宏基因组测序技术分析了南极大磷虾中共附生微生物的物种多样性,同时采用细菌纯培养技术获得可培养菌株,对菌株进行了抑菌活性、耐氟化钠特性分析.宏基因组测序结果表明,在南极大磷虾眼柄、尾部和肠道中,变形菌门(Proteobacteria)的群落相对丰度最高,分别占各组织细菌总量的41.4%、35.8%、59.5%;在南极大磷虾胃部,厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度最高,占细菌总量的32.2%.微生物多样性分析表明,南极大磷虾眼柄和尾部的微生物多样性和丰度高于胃部和肠道组织,肠道和胃部的微生物组成差异较大.采用细菌纯培养技术共获得60株细菌,其中有一株细菌对革兰氏阳性菌[单增李斯特菌LFM2813(Listeria monocytogenes LFM2813)、金黄色葡萄球菌LFM3263(Staphylococcus aureus LFM3263)、蜡样芽孢杆菌LFM2805(Bacillus cereus LFM2805)]有抑菌活性,并鉴定为马胃葡萄球菌(Staphylococcus equorum N J2),该细菌的抑菌产物具有耐高温和蛋白酶处理后失活的细菌素基本特征;同时,可培养细菌的最大氟化钠耐受浓度为1%,且耐受菌株占比为10%.研究初步揭示了南极大磷虾不同组织的微生物多样性和相对丰度,并探讨了微生物对宿主的防御功能,可为进一步开发利用南极大磷虾资源提供参考.
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超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱法测定养殖水中丁香酚和异丁香酚
《分析试验室 》 2022 EI 北大核心 CSCD
摘要：建立了超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱法（UPLC-Q-TOF-MS）测定养殖水中丁香酚和异丁香酚。水体样品经过丹磺酰氯（DNCL）快速衍生化处理后，采用ThermoAccucore C18色谱柱（100 mm×2.1 mm,2.6μm）对衍生物进行分离，以乙腈和0.1%甲酸水溶液为流动相进行梯度洗脱，Q-TOF-MS采用正离子全信息串联质谱扫描模式（MSE）进行数据采集分析。结果表明，丁香酚和异丁香酚在0.1～20μg/L质量浓度范围内具有良好的线性关系，相关系数（r）大于0.995，水体中的加标回收率分别为83.2%～102%和91.8%～104%，相对标准偏差均小于15%，检出限分别为0.02和0.05μg/L，定量限分别为0.05和0.1μg/L。该方法适用于水产养殖水中丁香酚和异丁香酚的快速测定。
关键词： 超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱 丹磺酰氯 养殖水 丁香酚 异丁香酚
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大亚湾西部海域海地瓜的空间分布及其栖息环境分析
《应用海洋学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：本研究于2020年1月(冬季)、3月(春季)、8月(夏季)和11月(秋季)对大亚湾西部海域的海地瓜(Acaudina molpadioides)空间分布和环境特征进行了调查研究,并结合室内养殖实验,分析了海地瓜的空间分布规律和栖息特性.结果表明:①海地瓜最高生物量达到170 g/m2,其栖息生境为粘土质粉砂和砂质粉砂,低温季节具有较高生物量.②主成分分析(principal component analy-sis,PCA)发现,有海地瓜分布的站位环境特征表现为较大的水深、盐度和溶解氧浓度,以及较低的水温、叶绿素a含量和较细的底质.③海地瓜的埋栖特征表现为口部向下、尾部朝上,以粘土质粉砂层下的黑色胶泥为食.④经组织切片观察,海地瓜体壁表层无管足,口部有15个触手.海地瓜体表运动器官缺乏,附着能力较弱.⑤主成分分析结果表明,大亚湾西部海域适宜海地瓜栖息的底质为粘土质粉砂,常出现在盐度较高、温度较低的深水区域.冬季和春季的调查数量高于其他季节,这需要进一步研究其生活史以明确其在不同时期内的生活习性.
关键词： 海洋生物学 海地瓜 空间分布 栖息环境 大亚湾西部海域
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汉江支流堵河鱼类群落结构及多样性
《生态学杂志 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：基于堵河2018年6月-2019年5月渔获物,分析了鱼类群落组成及变化、优势种以及群落多样性时空分布特征,讨论了外界环境扰动作用对鱼类群落结构和生物多样性的影响.结果 表明:调查期间共采集鱼类38种,分属4目8科,其中鲤形目鱼类最多(26种),占总种数的68.4%.群落优势种为鳙(Aristichthys nobilis)、马口鱼(Opsariichthys bidens)、(鳖)(Hemiculter leucusculus);生态类型主要以杂食性、底层性、定居性鱼类为主,分别占总物种数的50.0%、50.0%和89.5%;渔获物的相对重量以鲢(Hypophthalmichthys molitrix)、鳙为主,分别占总重量的49.8%、16.6%,相对数量以马口鱼、(鳖)、宽鳍鱲(Zacco platypus)为主,分别占总数的30.0%、17.4%、12.7%;鱼类群落的多样性指数处于一般至较丰富水平,其中中游S3区域Shannon指数(H)、Maragalef指数(R)和Pielou指数(J)均高于上游S1、S2和下游S4区域,夏季和秋季的H、R指数均高于春冬季,但.J指数为春冬季高于夏秋季;不同采样时间的鱼类群落相似性指数(S ′)均介于0.50~0.75,为中等相似及以上,不同采样区域的S′除S1与S3间和S1与S4间为中等不相似外,其余均为中等相似(S′>0.50);ABC曲线表现为生物量曲线在丰度曲线上方,W统计为0.0267>0,表明现阶段堵河水系鱼类群落受外界扰动影响较小,鱼类群落较为稳定,但与历史数据相比,鱼类种类和生态类型均有一定变化.根据上述结果提出了堵河鱼类资源的保护建议.
关键词： 堵河;鱼类;群落结构;生物多样性
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条斑紫菜多糖对白鲢鱼鱼糜凝胶特性及抗氧化活性的影响
《食品与发酵工业 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为改善鱼糜制品品质,研究了紫菜多糖对白鲢鱼鱼糜凝胶特性、水分状态、微观结构、蛋白质二级结构及抗氧化活性的影响.结果表明,添加0.4%(质量分数,下同)的紫菜多糖可显著改善鲢鱼鱼糜凝胶强度、质构特性和持水性,白度在可接受范围内.水分状态结果表明,添加紫菜多糖可缩短鱼糜凝胶弛豫时间T2,并使部分自由水转化为束缚水.在扫描电镜下观察到,添加0.4%多糖的鱼糜具有最均匀致密的三维凝胶网络结构.但过量的多糖会干扰与蛋白质分子之间的相互作用,破坏凝胶网络结构,导致凝胶品质下降.傅里叶变换红外光谱分析证实,多糖添加量为0% ~0.4%时,α-螺旋含量显著下降,β-转角含量增加(P<0.05);当添加量超过0.4%后,α-螺旋含量逐渐回升,β-转角呈相反趋势.抗氧化实验表明,添加紫菜多糖的鱼糜凝胶与对照组相比表现出更加优异的DPPH自由基、·OH和ABTS阳离子自由基清除能力,且以剂量依赖性方式抑制蛋白质氧化.
关键词： 白鲢鱼鱼糜 紫菜多糖 凝胶特性 持水性 微观结构 蛋白构象 抗氧化活性
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北方寒区2龄和3龄雄性中华绒螯蟹成蟹可食率、色泽及品质比较
《中国水产科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为开发中华绒螯蟹（Eriocheirsinensis）新种质并阐述其品质特征,本研究以北方寒区2龄雄性成熟中华绒螯蟹（简称2龄蟹）为对照,探究3龄雄性成熟中华绒螯蟹（简称3龄蟹）的可食率、色泽、常规营养品质、脂肪酸、游离氨基酸和矿物质元素差异,为3龄蟹新种质开发和利用提供重要的判断依据。结果表明;9月15日2龄蟹肝胰腺指数（HSI）极显著高于3龄蟹（P＜0.01）,而出肉率（MY）则显著低于3龄蟹（P＜0.05）。2龄蟹与3龄蟹相比,头胸甲和肝胰腺湿样L*,头胸甲和肝胰腺干样a*存在显著性差异（P＜0.05）。2龄蟹肝胰腺中粗脂肪含量显著高于3龄蟹（P＜0.05）,而性腺系统和肌肉中粗蛋白含量则高于3龄蟹。就脂肪酸而言,2龄蟹肝胰腺、性腺系统和肌肉中DHA和DHA/EPA含量均高于3龄蟹,而ARA则低于3龄蟹。肌肉中脂肪酸显著性差异项（5项）明显高于肝胰腺（1项）和性腺系统（1项）。就游离氨基酸而言,2龄蟹肝胰腺、性腺系统和肌肉中总必需氨基酸（ΣEFAA）、总游离氨基酸（ΣFAA）均高于3龄蟹。性腺系统中显著性差异项（6项）明显高于肝胰腺（0项）和肌肉（2项）。2龄蟹肝胰腺和性腺系统中谷氨酸（Glu）、总鲜味氨基酸（ΣTUV）高于3龄蟹,而肌肉中则低于3龄蟹。就矿物质元素而言, 2龄蟹3种可食组织中Na、K、Ca、Mg和Cu元素含量均低于3龄蟹。肝胰腺中矿物质元素显著性差异项（5项）明显高于性腺系统（1项）和肌肉（2项）。综上所述,2龄蟹大部分常规营养成分、脂肪酸、游离氨基酸指标均优于3龄蟹,但可食率参数、大部分矿物质元素含量则明显低于3龄蟹。整体来看, 2龄和3龄雄蟹各有优势,均具有较高的营养价值。
关键词： 中华绒螯蟹 3龄蟹 色泽 脂肪酸 游离氨基酸 矿物质元素
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淮河荆涂峡鲤、长吻鮠国家级水产种质资源保护区浮游植物群落结构的时空格局及影响因子
《大连海洋大学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为了解淮河荆涂峡鲤、长吻鮠国家级水产种质资源保护区浮游植物群落结构的时空格局及其与环境因子的关系,于2020年冬季(1月)、春季(4月)、夏季(8月)和秋季(10月),分别对保护区18个采样点,按照每个季节采样1次的频次开展了浮游植物和水质的调查研究.结果表明:调查期间,保护区共鉴定出浮游植物8门71属143种,浮游植物种类主要为蓝藻门、硅藻门和绿藻门,合计占比85.31%;浮游植物优势种主要为梅尼小环藻Cyclotella meneghiniana、尖尾蓝隐藻Chroomonas acuta等13种;保护区浮游植物Shannon-Wiener多样性指数变动范围为1.48~3.08,其中春季和冬季显著低于夏季和秋季(P<0.05);Pielou均匀度指数变动范围为0.46~0.96,季节上无显著性差异(P>0.05);Margalef丰富度指数变动范围为0.48~2.58,其中冬季显著低于其他3个季节(P<0.05),呈现夏季最高、冬季最低的态势;保护区浮游植物细胞密度变化范围为9.84×104~7.86×107 cells/L,生物量变化范围为0.02~29.07 mg/L,浮游植物密度和生物量在季节上无明显差异,但在空间上涡河水域显著高于淮河干流(P<0.05);春、夏、秋和冬季影响保护区浮游植物群落时空分布的主要环境因子分别为透明度(SD)、总氮(TN)、水深(WD)和高锰酸盐指数(CODMn).研究表明,保护区流域内水质均处于轻度富营养化状态,浮游植物密度及生物量在时间格局上无明显差异,但空间格局上涡河显著高于淮河干流,应重视不同季节的主要环境影响因子,以维护浮游植物多样性.
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