科研产出
橄榄ISSR和RAPD遗传多样性分析和核心种质构建
《热带亚热带植物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为揭示中国橄榄(Canarium album)种质资源的遗传多样性,采用ISSR和RAPD标记对橄榄主要分布区的86份种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质.结果表明,基于UPGMA遗传相似系数,86份种质资源可分为3个大类;基于STRUCTURE模型聚类,可分为4个类群,这基本符合橄榄的地域性分布规律.采用ISSR和RAPD获得的中国橄榄种质资源的整体遗传多样性水平分别为0.284±0.169和0.244±0.163,多态性位点百分率分别为92.56%和100%,总遗传分化系数分别为0.127和0.142,基因流分别为3.423和3.025,群体间遗传相似系数分别为0.930和0.939,个体间遗传相似系数分别为0.736和0.732.因此,中国橄榄种质资源丰富的遗传多样性主要来源于个体间的遗传分化或变异,且这种遗传多样性存在明显的地域性差异.
全文链接
请求原文
一株拮抗链霉菌SM3-7的鉴定及其对玉米茎基腐病的防效
《中国生物防治学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为获得对玉米茎基腐病具有良好防效的拮抗菌株，从玉米根际土壤中分离以玉米茎基腐病拟轮枝镰孢菌Fusarium verticillioides为靶标菌的拮抗放线菌菌株。采用平板对峙法测定不同菌株的抑菌活性，用抑菌圈法筛选效果良好的拮抗菌株并进行种类鉴定、抑菌谱和防效测定。结果表明，从土壤中分离并筛选获得1株对拟轮枝镰孢菌具有明显抑制作用的菌株SM3-7。经形态学、生理生化特征和16S rDNA系统发育分析，将菌株SM3-7鉴定为核粒链霉菌Streptomyces sclerogranulatus。该菌株抑菌谱广，对玉米上的8种植物病原菌有良好的抑制作用，对拟轮枝镰孢菌抑菌圈直径可达（28.03±0.45）mm。盆栽防效结果表明，菌株SM3-7发酵液对抗病品种“良玉99”和感病品种“全玉1233”的玉米茎基腐病14 d防效分别达77.28%和76.12%,21 d防效达72.20%和71.89%。核粒链霉菌菌株SM3-7发酵液可有效防治玉米茎基腐病，为利用微生物防治玉米茎基腐病拟轮枝镰孢菌提供参考。
全文链接
请求原文
超高效液相色谱-串联质谱法同时测定水产品中70种农药残留
《分析科学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：建立了超高效液相色谱-串联质谱法(UPLC-MS/MS)同时测定水产品中杀虫剂、杀菌剂、除草剂等70种农药残留的分析方法.样品经1%甲酸乙腈溶液提取,以N-丙基乙二胺(PSA)、C18以及无水MgSO4等分散固相萃取进行净化.色谱采用 Waters Acquity UPLC TSS T3 色谱柱(100 mm×2.1 mm×1.8 μm)分离,以 0.1%甲酸-5 mmol/L NH4Ac水溶液和甲醇为流动相,在多反应监测模式(MRM)下进行测定,以空白基质匹配外标法定量.结果表明,70种农药在0.2~100 ng/mL质量浓度范围内具有良好的线性关系,相关系数(r2)均大于0.99,方法定量限在0.5~5 μg/kg之间,在加标水平为1~20 μg/kg下,鳗鱼和对虾基质中平均回收率范围为70.2%~119.6%,相对标准偏差(RSD,n=6)在3.6%~9.8%之间.该方法灵敏度高,为水产品中多种农药残留筛查监测提供一种简便、可靠的方法.
关键词： 分散固相萃取 农药残留 超高效液相色谱-串联质谱法 水产品
全文链接
请求原文
内源激素对砂梨花芽休眠进程的调控作用
《福建农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析砂梨花芽休眠进程中内源激素的含量及平衡关系对梨花芽休眠进程的调控作用，为研究南方短低温梨花芽休眠解除的调控机理奠定基础。【方法】以黄花梨和蜜雪梨2个砂梨品种花芽为试材，利用HPLC技术分析赤霉素（GA3）、脱落酸（ABA）、3-吲哚乙酸（IAA）、玉米素（ZT）等4种内源激素含量以及GA3/ABA、IAA/ABA、ZT/ABA、（IAA+GA3）/ABA比值在2个砂梨品种花芽休眠进程中的变化。【结果】在砂梨花芽休眠进程中，GA3和ABA的影响主要在内休眠解除启动期，并且GA3促进了花芽内休眠解除启动，而ABA抑制了花芽休眠解除启动；IAA在休眠进程中的变化规律不明显，对于休眠解除的影响不显著；ZT在黄花梨中促进了内休眠的解除，而在蜜雪梨中则作用于内休眠解除的启动。GA3/ABA和（IAA+GA3）/ABA在砂梨花芽休眠进程中变化趋势基本相同，均表现出在内休眠阶段比值较小，并且变化趋势不明显，而内休眠解除启动时明显升高，并且在内休眠解除时稍低于内休眠解除启动期；IAA/ABA其对休眠进程的影响较小；ZT/ABA的比值在黄花梨花芽休眠解除启动期稍低于内休眠解除期，而在蜜雪梨中花芽休眠解除启动期会稍高于内休眠解除期。【结论】砂梨花芽休眠进程中GA3和ABA两种內源激素起主要作用，ZT不能直接影响休眠进程，而且内源激素调控花芽的休眠进程更主要取决于各内源激素的平衡。不同品种之间內源激素变化不完全一致，但总的趋势相似，本研究为內源激素调控休眠的研究奠定了基础。
全文链接
请求原文
鸭星状病毒3型TaqMan探针荧光定量PCR检测方法的建立与应用
《中国兽医学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：根据已报道的鸭星状病毒3型(duck astrovirus-3,DAstV-3)毒株的nsp1a基因序列设计并合成特异性引物和探针,经优化反应条件建立一种以nsp1a基因为靶标的检测DAstV-3的TaqMan实时荧光定量PCR方法.结果显示,该方法的Ct与标准品模板浓度在2.13×101~2.13×107拷贝/μL之间线性关系良好,相关系数R2和扩增效率分别为0.997和1.09;该方法仅特异性检出DAstV-3核酸,而对其他鸭常见病毒核酸无扩增反应;最低检测下限为21.30拷贝/μL;组内和组间重复试验变异系数分别为0.58%~2.19%和0.68%~2.53%,均低于5.00%;利用所建方法对临床采集的231份疑似DAstV-3感染病料进行检测,发现DAstV-3的阳性率为57.10%(132/231).结果表明,本试验所建方法操作简便、特异、敏感、重复性好,为DAstV-3的临床检测和流行病学调查提供技术支持.
关键词： 鸭星状病毒3型 nsp1a基因 TaqMan 实时荧光定量PCR
全文链接
请求原文
高茶氨酸茶树新品系'福黄1号'黄化变异机理
《中国农业科学 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析茶树黄化变异相关的代谢和转录机制,探究高茶氨酸茶树新品系'福黄1号'的黄化变异和高茶氨酸形成机理.[方法]以茶树'福安大白茶'及其黄化突变种质'福黄1号'为试验材料,利用超微电镜、广泛靶向代谢组学、靶向代谢组学及转录组学联合分析,确定茶树黄化变异相关的色素、代谢物及转录组数据.[结果]超微结构显示,'福黄1号'的叶绿体类囊体呈现丝状,基粒片层排列散乱不规则,片层间疏松,存在许多异常的囊泡.色素含量测定表明,叶绿素a和叶绿素b含量显著下降,叶绿素a/b比率下降,相关基因SGR表达显著下调,黄化叶片中光捕获叶绿素a/b蛋白(LHC)表达显著下调.类胡萝卜素总含量虽然差异不大,但各组分含量显著变化,玉米黄质为唯一显著增加的组分,其调控基因VDE表达显著上调,其余组分含量均下降.与'福安大白茶'相比,'福黄1号'中共鉴定到680个差异表达基因(DEGs)和57个显著变化的代谢物(SCMs).KEGG富集分析表明,SCMs和DEGs显著富集到氨基酸生物合成、谷胱甘肽代谢以及TCA循环等途径.此外,与碳和氮代谢相关的通路也被激活.通过靶向测定,共鉴定到19种游离氨基酸,新品系'福黄1号'游离氨基酸含量显著高于'福安大白茶',达到97.13mg·g-1,其中茶氨酸为66.90 mg·g-1,占氨基酸含量的68.89%,而精氨酸含量达到8.46 mg·g-1,是'福安大白茶'的56.4倍.调控氨基酸合成的G0GAT和GLU的表达量上调1.17倍和3.17倍.[结论]'福黄1号'的芽叶色泽主要受叶绿素、类胡萝卜素和类黄酮等色素代谢的影响,SGR和4种LHCs的共同作用也可能影响叶绿体的生物合成来调节叶片色泽.'福黄1号'茶氨酸含量显著高于'福安大白茶'的原因主要是泛素化相关的蛋白质水解酶表达上调蛋白降解能力加强,叶绿素和其他含氮分子生物合成的减少,以及黄化叶中碳骨架的缺乏,氨基和氮资源被更有效地储存,使得与氨基酸合成相关的氮代谢激活,茶氨酸合成前体物质之一的谷氨酸积累,这可能促使茶氨酸成为黄化叶中显著积累的含氮化合物.
全文链接
请求原文
西葫芦CCD基因家族鉴定及其在果实发育中的表达
《西北植物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：类胡萝卜素裂解双加氧酶(carotenoid cleavage dioxygenase,CCD)是类胡萝卜素氧化裂解途径中的关键酶,在植物生长发育、香气形成及胁迫响应等过程中均发挥着重要作用.该研究运用生物信息学方法从西葫芦全基因组中鉴定出13条具有完整RPE65保守结构域的CCD基因,为进一步解析CCD基因家族在西葫芦中的功能奠定基础.结果表明:(1)聚类分析显示,13个西葫芦CCD基因编码的蛋白可分为CCD1、CCD4、CCD7、CCD8、NCED、CCD1-like共6个亚组,且CCD8和CCD7亚组与其他家族成员的遗传距离较远.(2)顺式作用元件预测分析发现,CCD基因启动子中含有光信号、激素、环境胁迫和生长发育响应元件.(3)转录组数据分析显示,CCD家族基因具有组织表达特异性,其中3个CCD基因在组织中不表达,CpCCD1基因在叶和果实中显著高表达.(4)在果实发育过程中,8个CCD基因呈现上调表达,2个CCD基因呈现下调表达,其中CpCCD1、CpCCD4a、CpC-CD4b、CpCCD8a这4个CCD基因在果实膨大生长期或成熟期出现显著高表达,推测它们可能在西葫芦果实发育过程中具有重要的调控作用.
全文链接
请求原文
‘芙蓉李’糖转运蛋白家族基因鉴定及表达分析
《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：基于‘芙蓉李’（Prunus salicina）基因组数据，采用生物信息学分析方法鉴定糖转运蛋白家族基因，并对其蛋白质理化特性、亚细胞定位、系统进化树、蛋白质保守结构域以及表达模式进行分析。共鉴定出49个该家族基因，根据保守结构域和系统发育分析将其分为7个亚家族。蛋白质介于313～948个氨基酸之间，预测定位于质膜或液泡膜；所有的蛋白都含有保守的糖转运体结构域（PF00083），其中大多数含有12个跨膜螺旋。通过比对‘芙蓉李’果实发育过程的RNA-seq数据，对49个基因进行表达谱分析，其中15个在果实不同发育阶段差异表达；qRT-PCR分析表明，15个差异表达基因中有9个基因与果实葡萄糖和蔗糖含量显著正/负相关，其中1个肌醇转运蛋白亚家族基因（PsINT4）、1个糖转运蛋白亚家族基因（PsSTP11）、1个糖促进蛋白亚家族基因（PsSFP5）和1个液泡单糖转运蛋白亚家族基因（PsTMT1）在‘芙蓉李’果实发育过程中具有较高的表达量，可能在‘芙蓉李’果实发育和成熟过程中对糖分积累起重要作用。
关键词： 李 基因组 糖转运 基因家族 鉴定 生物信息学 表达分析
全文链接
请求原文
