科研产出
番鸭呼肠孤病毒M(M1~M3)基因序列克隆及特性分析
《福建农业学报 》 2012
摘要:参考Genbank番鸭呼肠孤病毒(muscovy duck reovirus,MDRV)中片段基因序列设计合成引物,对MDRV MW9710株中片段M基因RT-PCR扩增后,进行测序和特性分析。结果显示MW9710株M1基因全长2 283bp,与MDRV S14株同源性为99.9%,与ARV同源性小于74%。M1基因仅有1个编码框13~2 211bp,编码μA蛋白,含732个氨基酸。M2基因序列全长2 155bp,与MDRV S14株同源性为99.9%,与ARV同源性小于69%。M2基因仅有1个编码框28~2 058bp,编码外壳μB蛋白。M3基因序列全长1 997bp,而ARVM3基因全长1 996bp。M3基因仅有1个编码框25~1 683bp,编码μNS蛋白。MDRV MW9710株M3基因核苷酸序列与MDRV 89330株的同源性为87.2%,与ARV同源性小于74%。MDRV MW9710株5′末端序列不保守:M1为5′-ACUUUUU,M2为5′-UCUUUUU,M3为5′-GCUUUUU,MDRV MW9710株3′末端序列UCAUC-3′保守。


基于LC/Q-TOF MS的芽胞杆菌代谢组学分析方法
《福建农业学报 》 2012
摘要:建立了基于LC/Q-TOF MS的代谢组学方法,对不同种的芽胞杆菌进行分析,获得具有显著差异性的潜在代谢标记物,并采用分层聚类和PCA数据处理方法对各芽胞杆菌进行分类,建立PLS-DA预测模型。结果表明,不同的芽胞杆菌种间具有显著性差异,该方法可从代谢水平上对芽胞杆菌种属进行分类,为芽胞杆菌的分类提供了一种新的技术手段。


猪嵴病毒福建株3D基因的克隆及遗传进化分析
《福建农业学报 》 2012
摘要:根据GenBank中登录的猪嵴病毒(porcine kobuvirus,PKV)3D基因序列特征设计特异性引物,采用RT-PCR方法从福建省某猪场采集腹泻粪便样品和小肠组织混合物中扩增猪嵴病毒3D基因,将扩增后的目的片段克隆后进行序列测定。结果表明,所扩增的目的片段编码有完整的3D开放阅读框,全长为1 407bp,编码有468个氨基酸。运用生物信息学软件,将获得3D基因序列和GenBank的猪嵴病毒株3D基因序列进行分析比较,该毒株的3D基因序列和SH-W-CHN/2010/China毒株的核苷酸同源性最高,为93.6%,与WH1株核苷酸同源性最低,为92%。从遗传进化上看,猪嵴病毒和其他中国株在遗传进化上处在一个同一分支,匈牙利分离株处在另一分支,表明猪嵴病毒可能在欧亚大陆上各自独立进化。


鸡黄病毒RT-PCR检测方法的建立
《中国预防兽医学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要:为建立鸡黄病毒(CFV)分子生物学检测方法,本研究以虫媒介黄病毒基因3'末端通用引物EMF1/VD8作为鉴别引物,以CFV分离株CJD-05为模板,建立了检测CFV的RT-PCR方法。RT-PCR扩增产物测序结果显示,其扩增片段为708 bp,而该方法对其它禽类病毒病原核酸的扩增结果均为阴性,表明该方法具有较高的特异性。扩增的特异性片段与GenBank中CFV、鸭黄病毒和鹅黄病毒序列同源性达到100%、98%和99%。对参考病毒进行梯度稀释检测,该方法检测CFV的敏感度可达10-3TCID50/0.1 mL。采用所建立的RT-PCR方法对2009年福建省部分鸡场的112份临床样品进行检测,结果显示37份为CFV阳性。本研究建立的RT-PCR方法可以作为CFV在临床检测和分子流行病学调查的一种检测方法。


运用关联度分析硒镧复合作用下巴西蘑菇氨基酸含量与砷含量的关系
《应用与环境生物学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要:通过采用混合培养料试验、日立8810型氨基酸自动分析仪和原子吸收法测定氨基酸含量和砷含量以及灰色系统理论分析关联度,研究了硒镧复合作用下巴西蘑菇子实体氨基酸含量和砷含量的变化和关系,为栽培砷含量低的巴西蘑菇提供科学依据.各硒镧复合处理的关联度排序为:B4>B1>B2>B0>B3.其中B4处理关联度最大,为0.835 1,B2最小,为0.726 9,说明硒镧浓度对巴西蘑菇子实体各氨基酸含量与砷含量有一定影响.各氨基酸含量与重金属砷含量关联度顺序为:丙氨酸>酪氨酸>胱氨酸>苯丙氨酸>赖氨酸>组氨酸>天门冬氨酸>异亮氨酸>苏氨酸>缬草氨酸>亮氨酸>甘氨酸>脯氨酸>精氨酸>丝氨酸>谷氨酸>甲硫氨酸.其中丙氨酸含量与砷含量关联度最大,为0.856 6,说明硒镧复合作用下巴西蘑菇子实体中丙氨酸含量与重金属砷含量的关系最为密切;关联度最小的是甲硫氨酸.
关键词: 巴西蘑菇 氨基酸 硒 镧 重金属砷 灰色系统理论 关联度


龙眼新品种(品系)的ISSR指纹图谱研究初探
《福建农业学报 》 2012
摘要:利用ISSR分子标记技术,以冬宝9号、高宝等6份龙眼新品种(品系)与我国11份主栽品种为试材,构建17份龙眼品种(品系)的DNA指纹图谱。从30条ISSR引物中筛选出5条稳定的多态性引物。采用NTSYS-PC 2.0进行聚类分析,17份龙眼种质的遗传相似系数为0.75~0.93,在0.785的水平可将试材分为4个类群。引物py-9可将17个龙眼品种(品系)区分开,并依此建立了数字化的DNA指纹图谱,为探索龙眼新品种的鉴别、资源评价利用等方面提供了重要的依据。


夏黑无核葡萄优质高效栽培技术
《中国南方果树 》 2012 北大核心
摘要:为适应果树品种结构调整需要,促进优势特色果业健康发展,福建省源丰农业科技有限公司2010年开始在三明市梅列区发展夏黑无核葡萄,建立生产基地33.33hm2。通过一系列标准化栽培措施,种植后第二

