科研产出
利用ACGM和EST-SSR标记对云贵高原野生山蚂蝗属种质的遗传多样性分析
《草业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:山蚂蝗属野生种质是一个具有巨大经济价值的资源。本研究利用基于基因表达序列数据库开发的2种分子标记ACGM和EST-SSR共85对引物对山蚂蝗属9个种46个野生种质资源进行多样性分析。结果显示,ACGM引物中有扩增产物的引物比例为86.49%,远高于EST-SSR引物的54.17%。同时,ACGM的多态性比率也大于EST-SSR,可见ACGM在山蚂蝗属野生种质中的转移性优于EST-SSR。通过ACGM和EST-SSR分析得到的遗传相似性系数为0.523~0.967,平均相似系数为0.703,这表明山蚂蝗属野生种质资源间存在较高的遗传多样性。此外,ACGM分析能有效区分46个山蚂蝗属种质基因型,而EST-SSR只能区分绝大多数山蚂蝗属基因型。在UPGMA聚类图上46个供试材料被分成9组,与传统分类结果不完全一致。说明基于禾本科和豆科基因表达序列开发的分子标记能用于山蚂蝗属植物的遗传分析,同时这也为其他野生种质资源的遗传多样性研究提供了有益的借鉴。
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益智ISSR-PCR反应体系建立与优化
《生物技术 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:目的:获得适合的益智ISSR-PCR扩增反应体系。方法:利用正交设计L16(45)和单因素试验对益智ISSR-PCR反应体系的5因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTPs,引物)在4个水平上进行优化试验,将二者所得结果进行综合比较分析。结果:最终获得益智ISSR-PCR反应的最优体系(20μl)为:模板DNA100ng,Mg2+3.0mmol/L,引物0.8μmol/L,dNTPs0.25mmol/L,TaqDNA聚合酶1.0U。最后,对益智ISSR-PCR最佳反应体系进行梯度退火,得到最佳退火温度为50℃。结论:这一优化系统的建立为今后利用ISSR标记技术研究分析益智遗传多样性奠定基础。
关键词: 益智 ISSR-PCR 正交设计 单因素试验 体系优化
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二步倍增东方百合“星球战士”及提高组培苗移栽成活率的研究(英文)
《热带作物学报 》 2008 CSCD
摘要:采用二步倍增法直接再生了东方百合"星球战士"。鳞片切块培养在MS+4.4μmol/L BA+ 0.5μmol/LNAA的培养基上50 d后,再生出大量丛生芽。将丛生芽切块置于同样的培养基上进行诱导,40 d后,从基部短缩茎切片上诱导出了大量不定芽,但是根切段上不再生芽。一个中等大小的东方百合"星球战士"鳞茎120 d就可以再生出97 200个独立完整的新植株。研究还发现:加椰糠的培养基质最适于组培苗的驯化培养因而获得最高的移栽成活率。组培苗移栽后生长正常,2 a后正常开花。
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海洋放线菌Streptomyces sp. 124092中的细胞毒活性成分
《高等学校化学学报 》 2008 SCI 北大核心 CSCD
摘要:对海洋放线菌Streptomyces sp.发酵液的提取物进行柱层析分离,得到5个化合物.经MS,NMR,1H-1HCOSY,HSQC和HMBC等数据鉴定,其结构分别为3-氨基-丙酸对甲苯酯(1)、6-Amino-3-(4-hydroxy-benzyl)-1,4-diazonane-2,5-dione(2)、正丁基-α-D-吡喃甘露糖苷(3)、大豆苷元(4)和1H-3-吲哚甲酸(5).其中化合物1和2为新化合物,细胞毒活性测试结果表明,化合物1~4对人肝癌细胞(SMMC-7721)具有不同程度的生长抑制活性.
关键词: 海洋放线菌 Streptomyces sp. 细胞毒活性 分离和纯化
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尘螨变应原Der f 2基因克隆及序列分析
《第四军医大学学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:目的:获得尘螨变应原Derf2基因及其生物信息学资料.方法:提取粉尘螨总RNA,RT-PCR合成Derf2的cDNA片段,回收PCR产物并连接至pMD19-Tsimple,经测序验证后亚克隆入表达载体pET-28a(+),转化大肠杆菌感受态细胞后提取质粒,双酶切鉴定.用ExPaSy,EBI,NCBI网站的在线软件对测序结果进行分析.结果:RT-PCR扩增获得了Derf2cDNA片段,酶切、电泳结果表明克隆和亚克隆获得成功.与参考序列相比,测序结果多了87bp(77~163),但Blastn发现中国广州和德国Reinbek报道的序列中也含此87bp.同源性、相似性、序列比对及分子进化分析提示,该序列与中国广州和德国Reinbek报道的序列亲缘关系较近.推测该变应原由176个氨基酸组成,与附睾分泌蛋白E1具有同源性,信号肽位于1~17aa处,在6~24aa处有一跨膜螺旋.二级结构由a-螺旋(16.57%),延伸链(32.57%)和随机卷曲(50.86%)组成.结论:获得了粉尘螨变应原Derf2编码基因及其分子特征,为进一步生产基因工程变应原用于临床诊治变态反应性疾病奠定了基础.
关键词: 粉尘螨 Der f 2基因 克隆 变应原 生物信息学
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种子特异性启动子的研究进展
《安徽农业科学 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:启动子是基因表达的重要顺式调控元件。对植物基因启动子的核心结构与功能、种子特异性启动子的结构特点、植物基因启动子克隆的方法、已经克隆的种子特异启动子及存在的问题进行了综述,并对该领域的发展趋势进行了展望。
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红树植物卤蕨内生真菌Penicillium sp. 0935030中的抗菌活性成分研究
《中国抗生素杂志 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:为研究红树林植物卤蕨(Acrostichum aureurm)内生真菌Penicillium sp.0935030发酵物中的抗菌活性成分,采用活性追踪的方法,用多种色谱技术对化合物进行分离纯化,通过理化性质和光谱数据鉴定出7个化合物,分别为:环(脯氨酸-苏氨酸)(1),环(脯氨酸-酪氨酸)(2),1-呋喃基-1,2-乙二醇(3),(3β,4β,22β)-12-烯-3,22,23-三羟基-齐墩果烷(4),甘露醇(5),尿苷(6)和甘草素(7)。以上化合物均为首次从该真菌中分离得到。用滤纸片琼脂扩散法测定上述化合物的抗菌活性,其中化合物1、2和7具有明显抗金葡菌和耐甲氧西林金葡菌活性。
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巴西橡胶树热研7-33-97·PR107·RRIM600生理特性比较
《安徽农业科学 》 2008 北大核心 CSCD
摘要:[目的]为热研7-33-97推广提供科学依据。[方法]以3个橡胶树无性系热研7-33-97,PR107,RRIM600为试材,研究了不同品系的干胶含量,排胶初速度,堵塞指数,蔗糖,硫醇,无机磷,镁离子含量,黄色体破裂指数等生理指标。[结果]RRIM600、热研7-33-97和PR107的干胶总产量分别为538.725、26.89和409.37 g。3个品种干含依次为PR107>RRIM600>热研7-33-97。热研7-33-97蔗糖含量介于RRIM600和PR107之间。RRIM600硫醇含量较低,热研7-33-97与PR107硫醇含量较高。热研7-33-97与RRIM600无机磷含量较高。热研7-33-97镁离子含量最高。破裂指数以热研7-33-97最高,RRIM600最低。品系PR107的堵塞指数在各个阶段均明显高于热研7-33-97与RRIM600。[结论]热研7-33-97是一个较耐刺激且高产的品系。
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