中国水产科学研究院

• 淡水生态与健康养殖重点开放实验室

• 热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室

• 鲟鱼繁育工程技术中心

• 水生生物基因组研究中心

• 农业部渔业生态环境监测中心

• 农业部渔业遥感科学观测实验站

• 无公害渔药创制中心

• 信息技术研究中心

• 北京渔夫水产技术开发中心

• 海洋贝类研究室

• 鱼病研究室

• 院机关

• 北京鑫洋水产高新技术有限公司

• 下营增殖实验站

• 鲟鱼繁育技术工程中心

• 营口增殖实验站

• 渔业发展战略研究中心

• 杭州千岛湖鲟龙科技股份有限公司

• 淡水渔业研究所

• 长岛增殖实验站

• 质量与标准研究中心

• 信息与经济研究中心

• 黄河水产研究所

• 水产生物应用基因组中心

• 渔业资源与环境研究中心

• 北戴河中心实验站

• 渔业工程研究所

• 生物技术研究中心

• 渔业机械仪器研究所

• 黑龙江水产研究所

• 长江水产研究所

• 珠江水产研究所

• 淡水渔业研究中心

• 东海水产研究所

• 南海水产研究所

• 黄海水产研究所