陆地棉GhSUMO基因的克隆与黄萎病菌诱导表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵付安
作者: 赵付安;房卫平;杨晓杰;谢德意;李武;吕淑萍
作者机构:
关键词: 陆地棉;GhSUMO基因;电子克隆;诱导表达;定量PCR
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2011 年 30 卷 04 期
页码: 359-364
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: SUMO化修饰与植物抗病防御、信号转导和耐旱等有着直接的关系。本文以抑制差减杂交(sup-pression subtractive hybridization,SSH)技术获得SUMO的EST为信息探针,对棉花EST数据库进行同源搜索和电子克隆,获得了全长为396bp的SUMO基因编码区cDNA全长,我们将该基因命名为GhSUMO,推测该基因编码95个氨基酸。分别以抗黄萎病陆地棉品种豫棉21号的cDNA和DNA为模板,对该基因进行了PCR扩增验证,测序结果表明,GhSUMO基因序列与电子克隆序列一致,且没有内含子。蛋白序列分析表明,该蛋白具有保守泛素结构域和C端双Gly的断裂/连接位点,以及保守的疏水表面和Ulp1-Smt3互作位点。系统进化分析表明,该蛋白与蓖麻的同源序列表现了最高的相似性,与其它双子叶植物同源序列次之,而与单子叶植物的相似性较低。棉苗接菌后实时定量PCR结果显示,该基因表达量在接黄萎病菌的量48h后明显上调,96h达到未接菌对照的5倍以上。GhSUMO基因可受黄萎病菌诱导表达,表明该基因在陆地棉抗黄萎病的机制中可能发挥重要作用。
分类号: S562`Q943.2
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