东北三省9株嗜水气单胞菌16S rDNA序列比较研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王荻

作者： 王荻;李绍戊;刘红柏;尹家胜;卢彤岩

作者机构：

关键词： 嗜水气单胞菌;16S rDNA;黑龙江;吉林;辽宁

期刊名称： 水产学杂志

ISSN： 1005-3832

年卷期： 2010 年 23 卷 02 期

页码： 11-15

摘要： 采用特异性引物对采自黑龙江、吉林及辽宁省的9个嗜水气单胞菌分离株的保守基因16SrDNA部分序列进行PCR特异性扩增,对所得686bp扩增产物进行测序并比较研究。序列分析显示,东北三省的9个分离株同源性极高,都在百分之九十以上,测得基因序列共有保守位点613个,变异位点73个,简约信息位点3个。辽宁省与吉林省分离株遗传距离为0.005049;辽宁省与黑龙江省为0.005049;而吉林省与黑龙江省为0.004232。以致伤弧菌为外群的MP及NJ聚类树聚类结果一致,黑龙江省的第一和第二分离株聚成一个分支,而其他各分离株聚成另外一个大的分支,其中辽宁省的第二分离株与吉林省的第一和第二分离株又聚为一个较小的分支。实验结果表明,9个分离株相应保守区16SrDNA片段变化较小,同源性极高,聚类不明显,没有形成明显的区域性或特异性的变化。

分类号： S941

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