鸭疫里默氏菌感染对鸭肠道菌群结构的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陶志云

作者： 陶志云;朱春红;施祖灏;徐文娟;章双杰;宋卫涛;刘宏祥;李慧芳

作者机构：

关键词： 鸭疫里默氏菌;16S rDNA;鸭;肠道菌群结构

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 2129-2139

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在分析鸭疫里默氏菌（RA）感染不同时期鸭肠道菌群结构变化规律,探讨鸭疫里默氏菌对鸭肠道微生物的影响及引起鸭致病的可能机制。采用细菌16S V4-V5区扩增通用引物,扩增鸭疫里默氏菌未感染组（鸭疫里默氏菌感染0 d组）,鸭疫里默氏菌感染后1、2、3、5、9和14 d的鸭直肠内容物样本DNA,将扩增得到的产物进行DNA建库后基于Ion S5TMXL测序平台测序。测序得到的Raw Reads数据总量为4 710 688条序列,平均每个样本84 119条序列。共注释到数据库的操作分类单元（OTUs）数目为4 528。Alpha多样性分析结果表明,菌群多样性指数Shannon和Simpson在鸭疫里默氏菌感染组和未感染组间差异不显著（P>0.05）,菌群丰富度指数Chao1、Ace、Observed-species和PD-whole-tree在鸭疫里默氏菌感染后0～5 d逐渐降低,从5～14 d又逐渐增加,尤其在鸭疫里默氏菌感染后3和5 d均显著低于未感染组（P<0.05）。Beta多样性分析表明,未感染组与6个时间点的感染组间菌群差异均显著（P<0.05）,其中,未感染组与感染后3 d的物种差异最大,之后依次为感染后2、5、9、1和14 d。物种丰度聚类热图显示,在未感染组和不同时间感染组,物种丰度相对较高的微生物菌属均不同。在门水平,鸭疫里默氏菌感染组主要以厚壁菌门（Firmicutes）、unidentified-Bacteria、拟杆菌门（Bacteroidetes）、梭杆菌门（Fusobacteria）及变形菌门（Proteobacteria）为主;在属水平,Bacteroides在感染组和未感染组均为优势菌属,感染组中弯曲杆菌属（Campylobacter）和梭杆菌属（Fusobacterium）明显增加。本试验分析了鸭疫里默氏菌未感染组和感染不同时间组肠道菌群的差异,寻找到一些特征菌属,可为鸭疫里默氏菌的致病性研究提供理论依据。

分类号： S858.32

  • 相关文献

[1]鸭疫里默氏菌病疫苗的应用现状与展望. 万明,曹中赞,于堃,卢立志,栾新红. 2021

[2]鸭疫里默氏菌感染对鸭生长发育及肠黏膜屏障功能的影响. 陶志云,徐文娟,朱春红,施祖灏,刘宏祥,宋卫涛,章双杰,王志成,李慧芳. 2024

[3]黄连解毒散和黄霉素对不同日龄肉鸡回肠菌群结构的影响. 袁林,李万利,杜晨红,王志祥,易宝弟,王明发. 2020

[4]野生和养殖的异齿裂腹鱼肠道菌群结构分析. 王金林,王且鲁,王万良,曾本和,潘瑛子,周建设. 2020

[5]转IGF-1基因超细毛羊与非转基因羊肠道粪便菌群多样性及组成差异分析. 王新华,张星星,王立民,黄新,韩猛立,张译元,郭延华,唐红,何延华,钟发刚,周平. 2020

[6]岩藻多糖调控肠道黏膜屏障功能及其在动物生产中的应用. 韩丰韦,王哲奇,刘晓静,红雷,史彬林,徐元庆. 2024

[7]不同养殖模式对南美白对虾生长性能及肠道菌群的影响. 张海耿,吴小茜,姜世豪,宋红桥,张贺,於叶兵,张亚雷. 2023

[8]丁酸梭菌后期干预对番鸭回肠和盲肠菌群结构的影响. 樊倩,许旖旎,杨彩梅,肖英平,吕文涛,杨华. 2023

[9]乳酸菌对杂交鳢肠道菌群和生长的影响. 欧密,徐晟云,陈昆慈,罗青,刘海洋,梁新球,赵建. 2022

[10]嗜酸乳杆菌对3种弧菌的拮抗效果及对凡纳滨对虾肠道菌群结构的影响. 刘钢,胡晓娟,苏浩昌,徐武杰,徐煜,文国樑,曹煜成. 2024

[11]饲料中添加枯草芽孢杆菌对团头鲂幼鱼生长性能、肝脏抗氧化指标、肠道菌群结构和抗病力的影响. 孙盛明,苏艳莉,张武肖,戈贤平,朱健. 2016

[12]南美白对虾体表与肠道细菌菌群结构的DGGE分析. 张云鹏,朱立颖,肖朝耿,唐宏刚,陈黎洪,王欣,顾青. 2016

[13]放牧与舍饲条件下夏洛莱牛肠道微生物多样性及差异分析. 张星星,黄新,韩猛立,蒋烈戈,张倩,高攀,刘鹏,吴桐忠,钟发刚. 2021

[14]芸薹子对母鼠及其子鼠生产性能和肠道菌群结构的影响. 张巍,严念东,黄东海,樊启文,魏金涛. 2022

[15]池塘和工厂化养殖牙鲆肠道菌群结构的比较分析. 李存玉,徐永江,柳学周,杨洪军,史宝,史学营,朱学武. 2015

[16]番鸭盲肠菌群结构及其发育动态变化研究. 侯萌,温洋,曾洪波,吴海琴,肖英平,田亚东,宫玉杰,杨华. 2025

[17]鸭疫里默氏菌病和大肠杆菌病多重PCR诊断方法的建立. 王春平,韦强,鲍国连,崔言顺,刘燕,邵泽香,季权安,肖琛闻,李建亮. 2010

[18]黄连汤对鸭疫里默氏菌的抑菌作用及对菌体形态的影响. 张先福,韦强,鲍国连,季权安,庞安娜. 2010

[19]番鸭源鸭疫里默氏菌大环内脂类药物的耐药基因检测与分析. 林彬彬,谢碧林,翁汉东,王秀祯,程龙飞,傅光华,刘荣昌,林志敏. 2022

[20]鸭疫里默氏菌毒力相关因子研究进展. 李林林,孙敏华,董嘉文,张俊勤,黄允真,黄瑜,廖明. 2021

作者其他论文 更多>>

微信小程序