雷蒙德氏棉KNOX基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙润润

作者： 孙润润;秦腾飞;王园园;刘用生;郭新磊;余春丽;王清连

作者机构：

关键词： 雷蒙德氏棉;KNOX基因;进化分析;基因结构;表达模式

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 006 期

页码： 1763-1773

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探究KNOX基因家族在棉花生长发育中的调控作用，本研究以雷蒙德氏棉为材料，利用生物信息学的方法全基因组鉴定KNOX家族成员，并对其保守结构域、进化模式、染色体定位、基因结构和基因表达情况进行分析。共鉴定到22个KNOX基因，分布于10条染色体上，其中13个基因发生了片段复制。除GrKNOX9和GrKNOX15外，其余GrKNOX蛋白均含有KNOX1,KNOX2,ELK和HOX四个典型结构域。Gr KNOX基因家族进化聚类成两组：ClassⅠ和ClassⅡ。ClassⅠ组包含13个基因，ClassⅡ组含有9个基因。GrKNOX基因在叶片、花瓣、开花后10、20、30和40 d的种子中的表达分析显示，ClassⅠ组成员表达模式差别较大，ClassⅡ组成员表达模式较相似。GrKNOX12、GrKNOX1、GrKNOX17、GrKNOX2、GrKNOX11、GrKNOX3和GrKNOX22在测定的组织中表达量均较高；GrKNOX6、GrKNOX16和GrKNOX19在开花后20、30和40 d的种子中表达量较高，推测这3个基因参与调控棉花种子发育过程。本研究为进一步探究KNOX基因家族在棉花中的功能及进化模式提供科学依据。

分类号： S562

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