大通牦牛PDGFD基因克隆、生物信息学及组织表达谱分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李歆怡

作者： 李歆怡;王福彬;黄纯;马晓明;喇永福;褚敏;郭宪;阎萍;潘和平;梁春年

作者机构：

关键词： 大通牦牛;血小板源性生长因子D (PDGFD)基因;蛋白功能分析;脂肪组织;基因表达

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2023 年 31 卷 003 期

页码： 518-529

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 牦牛(Bos mutus)是高原地区十分重要的种质资源.为研究牦牛血小板源性生长因子D(platelet-derived growth factor D,PDGFD)基因的结构及功能,并探究其在牦牛不同年龄的7个组织中的表达情况,本研究以36月龄大通牦牛的皮下脂肪组织cDNA为模板克隆牦牛PDGFD基因的CDS序列,利用基因序列进行生物信息学分析及蛋白理化性质预测,qPCR检测PDGFD在大通牦牛胚胎期150 d与36月龄成年时期2个年龄段7个组织(心,肝,脾,肺,肾,背最长肌,皮下脂肪)中的相对表达量.结果表明,大通牦牛PDGFD的CDS区全长为1095 bp,共编码氨基酸364个,同野牦牛PDGFD基因的亲缘关系最近(99.8%),与猪(Sus scrofa)最远(91.2%);牦牛PDGFD蛋白预测为稳定的亲水性分泌蛋白,无跨膜结构域,存在1个CUB结构域(116 aa)及1个PDGF结构域(93 aa);PDGFD蛋白高级结构由无规则卷曲(48.21%)、α-螺旋(25.62%)、延伸链(21.49%)和β-转角(4.68%)相互连接而成,主要与同为血小板源性生长因子、血管内皮生长因子相关蛋白相互作用.qPCR结果显示,牦牛2个发育阶段的7个组织中均有PDGFD基因的表达,在对比2个时期的PDGFD基因组织表达规律后发现,心脏中的基因表达维持在较高水平,脂肪组织中的基因表达量变化最大,随着牦牛生长极显著升高(P<0.001).推测PDGFD基因与牦牛心脏发育有着密切关系,在生长发育过程中影响脂肪的沉积.本研究为PFGFD基因在牦牛脂肪沉积的调控机制的研究提供理论依据,可以作为牦牛的遗传育种的参考.

分类号： S929.9

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