河北省马铃薯Y病毒株系分子鉴定及其RT-PCR检测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴志明

作者： 吴志明;时星;谢晓亮;温春秀;张庆良

作者机构：

关键词： 马铃薯Y病毒;反转录-聚合酶链式反应;病毒检测;外壳蛋白基因(CP);序列分析;株系鉴定

期刊名称： 河北农业大学学报

ISSN： 1000-1573

年卷期： 2005 年 28 卷 03 期

页码： 54-59

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据马铃薯Y病毒(PotatovirusY,PVY)的外壳蛋白基因序列,设计合成了一对寡核苷酸引物,从感染PVY的马铃薯田间病叶组织中提取出病毒的RNA,进行cDNA合成及PCR扩增,得到一条长度约800bp的特异PCR扩增产物,与理论设计的基因片段大小一致,本试验建立了快速、灵敏、简便的PVY检测的方法。将RT-PCR扩增产物克隆到质粒pGEM-T上,并进行了序列分析。结果表明,克隆的cDNA片段由801个核苷酸组成,编码267个氨基酸组成的理论分子量为29kD蛋白,与PVY外壳蛋白的大小一致,与基因库登记的代表性株系相比,它们之间的核苷酸序列同源性为89 6%～98 8%,氨基酸序列的同源性为93 3%～98 5%,说明PVYCP基因具有高度的保守性(记为PVY-HBEI),与国内报道的PVY-CHU、PVY-ZHJ和PVY-ZHOU株系的氨基酸序列同源性分别为96 6%、98 5%和97 8%,与PVYN和PVYO株系的氨基酸序列同源性分别为93 6%和97 8%,从分子水平上确定PVY-HBEI归属于普通株系(PVYO株系)。

分类号： S435.32

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