小麦TaCAT新基因克隆及分子生物学和生化特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 佘茂云

作者： 佘茂云;雷昊;殷桂香;冯晨;别晓敏;杜丽璞;徐惠君;叶兴国

作者机构：

关键词： 小麦;TaCAT;in silico;同源建模

期刊名称： 科技导报

ISSN： 1000-7857

年卷期： 2011 年 29 卷 12 期

页码： 23-31

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 小麦组织培养再生潜力与抗氧化胁迫能力具有相关性。为解析小麦TaCATs基因家族的分子生物学及生化特性并为后续试验验证奠定理论基础,利用e-PCR方法进行小麦过氧化氢酶(CAT)新基因克隆,结合in silico技术对小麦TaCATs基因家族的生化特性进行分析和预测。氨基酸序列同源性比对结果表明,克隆的小麦TaCATs基因家族新成员与水稻的CatA和玉米的Cat3具有较高的相似性,分别达89%及81.1%,命名为TaCAT3,基因组DNA和cDNA长度分别为1986和1482bp,编码494个氨基酸的蛋白。亚细胞定位结果表明,TaCAT3可能定位在线粒体中,且所有的功能活性位点在小麦TaCATs家族中具有一致的保守性。系统发生树构建结果表明,小麦TaCATs能形成3个独立的分支。在蛋白质编码序列同源比对的基础上,利用SwissModel的Swiss-PdbViewer 3.7软件包对TaCATs高级结构进行同源模拟,发现所构建的模型能很好地反映TaCATs的高级结构。

分类号： S512.1

  • 相关文献

[1]借助斑马鱼EST数据库从鲤鱼微卫星序列中寻找蛋白编码基因(英文). 常玉梅,匡友谊,梁利群,鲁翠云,何建国,孙效文. 2008

[2]唾液乳杆菌BSH1及其突变体的底物特异性. 毕洁,方芳,仇钰莹,杨庆利,陈坚. 2014

[3]几种经济植物UFGT基因的生物信息学分析. 付海辉,辛培尧,许玉兰,刘岩,韦援教,董娇,曹有龙,周军. 2011

[4]环糊精水解酶cds1-3底物通道氨基酸的定点突变研究. 汤宏赤,莫莉,闭海,林丽华,郭媛,庞浩. 2019

[5]五种琥珀酸脱氢酶抑制剂类杀菌剂与灰葡萄孢琥珀酸脱氢酶的结合模式及抗性机制分析. 陶丽红,李佳俊,夏美荣,李康,范黎明,苏发武,吴文伟,王凯博,叶敏. 2021

[6]口蹄疫病毒氨基酸改造对其病毒样颗粒稳定性的影响. 李璐莹,董虎,卢渊录,王苗苗,孙世琪,郭慧琛. 2021

[7]华北大黑鳃金龟气味结合蛋白HoblOBP2的生物信息学分析. 尹姣,李克斌,曹雅忠. 2013

[8]甘薯膜结合态多酚氧化酶同源建模及分子对接分析. 李丰茂,杨浩,傅玉凡,陈晓玲,唐云明. 2021

[9]鹅IGF-Ⅰ基因cDNA的克隆、分析与原核表达. 王雷,王宝维,贾晓晖,杨志刚,刘光磊. 2008

[10]鸡组蛋白去乙酰化酶3的重组表达与结构信息学分析. 路义鑫,刘兵,马雪婷,殷昊,龚振兴,宋铭忻,袁金钱,蔡建平. 2014

[11]进化树指导的腺病毒六邻体家族蛋白的快速建模. 袁晓辉,王迎晨,曲章义,任家毅,王靖飞,郭莹莹,王雅贤,华东,吴晓敏,杨志伟,高虹. 2011

[12]病毒亲和肽的研究方法及进展（英文）. 张娜娜,卢清侠,滕蔓,杨艳艳,张以芳,张改平. 2016

[13]副猪嗜血杆菌肽聚糖相关脂蛋白(PalA)的序列分析及三维结构建模. 周伦江,车勇良,陈如敬,江斌,王隆柏,魏宏,吴学敏,庄向生. 2012

[14]GH46家族壳聚糖酶酸碱耐受性的关键氨基酸位点的鉴定. 程伊梦,孙慧慧,刘淇,赵玲,曹荣. 2022

[15]Asia 1型口蹄疫病毒VP1蛋白进化踪迹分析. 牛银杰,王靖飞. 2014

[16]嗜热子囊菌Thermoascus crustaceus JCM12803来源的低温α-淀粉酶功能验证及其适冷机制分析. 杨雄振,郭玉杰,涂涛,姚斌,罗会颖,缪礼鸿. 2018

[17]基于同源建模与分子对接技术构建抗Bt Cry1类毒素单链抗体定点饱和突变库. 焦凌霞,徐茜茜,刘媛,张霄,刘贝贝,梁颖,刘贤金. 2016

[18]禽流感分离株GD/1/96(H5N1)非结构蛋白结构建模. 郭莹莹,吴春艳,王靖飞. 2010

[19]小菜蛾碱性磷酸酯酶受体表达与分子模拟. 张霄,胡晓丹,仲建锋,武爱华,徐重新,刘媛,张存政,谢雅晶,刘贤金. 2016

[20]蓝舌病病毒新型NS4蛋白的亚细胞定位分析及功能预测. 吕爽,杨涛,孙恩成,徐青元,张继凯,吴东来. 2016

作者其他论文 更多>>

微信小程序