基于16S rRNA测序分析PRRSV感染仔猪肺和肠道中微生物菌群的变化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陆梦琪

作者： 陆梦琪;杨文杰;李萍;余鹏;董翎;牛晓玉;杨克礼;邹维华;宋卉

作者机构：

关键词： 繁殖与呼吸综合征病毒;肺部微生物;肠道微生物;16S rRNA基因测序

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 1664-1678

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本试验旨在探究猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV）感染对仔猪肺、肠道中的菌群影响以及肺和肠道的组织学变化。试验选取35日龄断奶健康仔猪14头，适应性饲养7 d,随机分为感染组（n=7）和对照组（n=7）,感染组仔猪接种2 mL 1×10~5 TCID50·mL-1PRRSV-JTS毒株病毒液，对照组仔猪接种2 mL DMEM培养基。感染组3头仔猪分别于10、12和19 d死亡，将存活的感染组与对照组仔猪于21 d后处死，并取肺、不同肠段组织样品以及肠道内容物。采用免疫组化染色和HE染色观察肺和肠道组织病理学变化，并基于16S rRNA基因的高通量测序分析仔猪肺和各肠段菌群结构。结果表明，感染组仔猪肺部和肠道均有病毒分布；与对照组仔猪相比，感染组仔猪肺部和肠道均存在明显的炎症反应。微生物组成结构及多样性分析显示，感染组仔猪Chao1、ACE指数在肺中上升，在仔猪各肠段中下降，Shannon、Simpon指数在肺中升高，在大多数肠道中下降。在门水平上，感染仔猪肠道变形菌门等有害微生物比例增加，而厚壁菌门等有益微生物比例下降；在科水平上，感染组肺、空肠中巴斯德菌科，十二指肠乳杆菌科，回肠肠杆菌科，盲肠、结肠、直肠中的瘤胃菌科相对比例有明显的下降，假单胞菌科在肺和十二指肠中的比例明显上升；在属水平上，感染组有益菌属乳酸菌属水平显著下降，β多样性证明小肠与大肠聚类效果具有一致性。综上，PRRSV致仔猪肺部病变和肠道炎症，影响肺部和肠道菌群组成、丰度和功能。

分类号： S858.28

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