拟南芥CBF4基因位点的单核苷酸多态性(SNP)变化与抗旱表型的相应性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郝岗平

作者： 郝岗平;吴忠义;陈茂盛;曹鸣庆;Dominique Brunnel;Georges Pelletier;黄丛林;杨清

作者机构：

关键词： CBF4基因;单核苷酸多态性;抗旱性状

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1006-1304

年卷期： 2004 年 12 卷 02 期

页码： 122-131

收录情况： CSCD

摘要： 以生长于不同生态气候条件下的17个拟南芥(Arabidopsisthaliana )核心生态型为材料,分析了它们的相对抗旱性和抗旱转录因子CBF4 基因的单核苷酸多态性(SNP)。结果表明,不同的拟南芥生态型具有差异明显的抗旱性。与拟南芥Columbia生态型相比,25av、203av和244av生态型的CBF4基因位点具有高密度的SNP和插入/缺失(Indel),多态性的频率为每35.8 bp 1个SNP,每143 bp 1个Indel。Tajima'S D统计学检验结果显示各区域都不显著,说明该区域核苷酸变化符合中性突变假说,较高的核苷酸多样性是净化选择的结果。基因非编码区的多态性是编码区的4倍,表明编码区承受着更大的选择压力。在编码区,SNP的频率为每96.4 bp 1个SNP,其中1034位(以GenBank No.AB015478序列第19 696位的核苷酸为1)碱基变化:G圮T,引起第205位氨基酸变化:gly圮val。而203av形成的haplotype 6具有4个特异的SNP变化,其中5'端非编码区3个:27位的A圮G,129位的A圮C,171位的G圮A;3'端非编码区1个:1106位的A圮C。抗旱性鉴定结果表明203av拟南芥是抗旱性最强的一个生态型, 研究认为haplotype 6与它较强的抗旱性表型相应。

分类号： Q945

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