桃甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术体系的建立
文献类型: 中文期刊
第一作者: 蔡志翔
作者: 蔡志翔;沈志军;严娟;马瑞娟;俞明亮
作者机构:
关键词: 桃;DNA甲基化;MSAP;体系优化
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2016 年 44 卷 11 期
页码: 43-45
收录情况: 北大核心
摘要: 为建立适合桃的甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplification polymorphism,简称MSAP)反应体系,以桃PCM-1R、PCM-1G为材料,对MSAP技术中的关键因素进行优化。结果表明,500 ng基因组DNA用EcoRⅠ、HapⅡ或MspⅠ各10 U(0.5μL,2 000 U/m L),37℃保温12 h,即可酶切完全;25μL选择性扩增体系中,含有2μL10倍稀释的预扩增产物、各1μL上下游引物、2.5μL 10×Taq buffer、2.5μL d NTP mix(各0.2 mmol/L)、2.5μL25 mmol/L MgCl_2、0.25μL Taq DNA聚合酶。在该体系下选用256对引物对桃叶片进行甲基化模式分析,经筛选获得23对扩增条带清晰、重复性好的引物,PCM-1R、PCM-1G总甲基化率分别为28.0%、25.7%。
分类号: S662.1
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