烟草表达抗病基因同源物(RGA)的鉴定及RGA-SSR标记的开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 袁清华

作者： 袁清华;谢锐鸿;张振臣;马柱文;李集勤;李淑玲;陈俊标

作者机构：

关键词： 烟草;表达序列标签;抗病基因同源物;SSR

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2014 年 40 卷 02 期

页码： 240-252

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 烟草是研究植物与病原菌互作的理想材料。鉴定烟草抗病基因及其同源物对揭示抗病机制具有重要意义。近年来公共数据库不断增长的EST序列为烟草表达RGA的鉴定提供丰富的数据。本研究通过拼接GenBank收录的412 325条烟草EST序列,获得149 606条Uni-EST序列。随后利用已克隆的112个植物R基因蛋白序列对其扫描,检测出1113个NtRGA,其中有273、546、53、102和30个分别包含NBS-LRR、LRR-PK、LRR、PK和Mlo结构域,另有109个未检测到结构域。通过序列比对将1071个NtRGA定位于N.benthamiana基因组712个位点上。经搜索,从72个NtRGA中检测出78个SSR,根据其侧翼序列设计64对引物。54对成功从烟草基因组DNA中扩增出清晰条带,9对在24个普通烟草品种间检测出多态性,检出等位基因数2~4个,平均2.56个;41对在6个烟草种间检测出多态性,检出等位基因数2~4个,平均2.61个。

分类号： S572

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