基于小RNA测序的甜樱桃病毒种类检测及鉴定

文献类型: 中文期刊

第一作者: 赵志惠

作者: 赵志惠;李丰;朱天生;高瑞;孙玉刚

作者机构:

关键词: 甜樱桃;病毒病;高通量测序

期刊名称: 落叶果树

ISSN: 1002-2910

年卷期: 2022 年 54 卷 002 期

页码: 9-13

摘要: 病毒病是甜樱桃的重要病害之一,利用高通量测序技术鉴定病毒病害种类,通过对2个表现"花脸"症状的甜樱桃样品YT-1和YT-2进行小RNA测序,并对获取的小RNA进行组装注释.结果表明,样品YT-1获得14190241条reads,鉴定到的主要病毒是樱桃小果病毒2,占小RNA的55.12%,还包括李属坏死环斑病毒、樱桃病毒病A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒、樱桃绿环斑驳病毒及啤酒花矮化类病毒;样品YT-2获得14954849条reads,鉴定到的主要病毒是李属坏死环斑病毒,占小RNA的59.05%,还包括樱桃病毒A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒及樱桃绿环斑驳病毒.

分类号: S662.5

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