小果野蕉microRNAs及其靶基因的生物信息学预测
文献类型: 中文期刊
第一作者: 叶可勇
作者: 叶可勇;陈瑶;李瑞梅;符少萍;郭建春
作者机构:
关键词: 小果野蕉;microRNAs(miRNAs);靶基因;生物信息学
期刊名称: 热带生物学报
ISSN: 1674-7054
年卷期: 2012 年 3 卷 03 期
页码: 222-227
摘要: 通过基于表达序列标签(EST)、基因组勘测序列(GSS)和高通量测序基因组序列(HTGS)的同源序列比对搜索,以及一系列的标准筛选,最终预测到属于8个家族的10条小果野蕉miRNAs。在线软件psRNATarget预测到24对miRNAs与靶基因的互作,这些靶基因主要参与小果野蕉的新陈代谢、生长发育以及胁迫响应等过程。
分类号: S668.1
- 相关文献
[1]茄子microRNAs与其靶基因的生物信息学预测. 张磊,晁江涛,崔萌萌,陈雅琼,宗鹏,孙玉合. 2011
[2]小果野蕉(Musa acuminata)全基因组NBS抗病基因的鉴定与分析. 刘梦雅,李伟明,吴伟,葛学军. 2014
[3]葡萄miR164家族生物信息学分析及靶基因预测. 王丽丽,葛金涛,刘兴满,赵统利. 2016
[4]基于生物信息学方法预测野葛中的miRNA及其靶基因. 姚怡玮,徐静,杨萌,李燕呢,何美军,郭坤元,吴斌. 2019
[5]miR-18a-5p在鸡不同生长时期的表达及其生物信息学分析与靶基因预测. 黄正洋,黄华云,穆春宇,李春苗,王钱保,黎寿丰,赵振华. 2021
[6]牛miR-320a的靶基因预测及生物信息学分析. 郭云涛,张秀秀,苗向阳. 2015
[7]猪miR-149靶基因预测及生物信息学分析. 张家庆,武松霞,任巧玲,王献伟,陈俊峰,王璟,白献晓,邢宝松. 2019
[8]利用生物信息学方法预测家蚕核型多角体病毒基因组编码的miRNA. 陈蔚,黄勇,赵巧玲,宋菲,裘智勇. 2011
[9]葡萄miR169及其靶基因的生物信息学分析. 曲俊杰,孙嘉曼,尹玲,潘凤英. 2017
[10]miR-370-3p在绵羊中的表达、生物信息学分析与靶基因预测. 王丹,张双双,贾琪,张新玉,付佳棋,张立春,孙福亮. 2024
[11]华支睾吸虫细胞外囊泡中miRNAs调控宿主靶基因的预测及生物信息学分析. 魏伟,孙云异,毛瑞锋,张爱辉,贾斌,张军,王春仁,高俊峰. 2023
[12]牦牛miR-383的靶基因预测及生物信息学分析. 周学兰,吴晓云,梁春年,郭宪,丁学智,褚敏,阎萍. 2021
[13]牦牛miR-381的靶基因预测及生物信息学分析. 周学兰,吴晓云,梁春年,郭宪,丁学智,褚敏,王宏博,裴杰,包鹏甲,阎萍. 2019
[14]牦牛miR-101的靶基因预测及生物信息学分析. 凌笑笑,吴晓云,梁春年,唐朋,王宏博,包鹏甲,郭宪,阎萍. 2017
[15]小果野蕉(Musa acuminate Colla)花粉母细胞减数分裂过程异常的细胞学观察. 程志号,李淑霞,孙佩光,孙长君,吴琼. 2018
[16]小果野蕉(Musa acuminate Colla)花粉母细胞减数分裂过程异常的细胞学观察. 程志号,李淑霞,孙佩光,孙长君,吴琼. 2018
[17]草莓叶片中5种新microRNA的RT-PCR鉴定及靶基因分析. 张馨宇,戚华彩,董向向,李贺,张志宏. 2016
[18]microRNA在植物生长发育中的作用. 刘海丽,丁艳菲,潘家荣,江琼,王光钺,朱诚. 2013
[19]特异性靶基因在弧菌PCR快速检测中的应用. 邵蓬,汪笑宇,徐晓丽. 2015
[20]小鼠体型控制相关microRNA-200b(miR-200b)的表达谱及靶标分析. 任红艳,刘楠,陶聪,郑建伟,李奎. 2013
作者其他论文 更多>>
-
云南梨地方品种果实表型性状多样性分析
作者:梁艳萍;董菲;黄文静;陈瑶;丁仁展;李坤明
关键词:梨;云南;地方品种;果实性状;多样性;电子鼻
-
甜樱桃果实软化研究进展
作者:陈瑶;艾佳音;何明莉;才丰;张琪静
关键词:甜樱桃;果实软化;细胞壁;研究进展
-
木薯MeCYP79D1和MeCYP79D2基因启动子克隆及表达模式分析
作者:王昕;符东青;李瑞梅;刘姣;郭建春;胡新文;姚远;王亚杰
关键词:木薯(Manihot esculenta);启动子克隆;基因表达;生氰糖苷
-
木薯MeAHL17基因的克隆及表达分析
作者:张亚文;王晓彤;张兴龙;唐湘宁;刘姣;郭建春
关键词:木薯;MeAHL17;基因克隆;亚细胞定位;转录活性分析;表达模式分析
-
甜樱桃果实品质研究进展
作者:陈瑶;才丰;艾佳音;何明莉;吴敏;张琪静
关键词:甜樱桃;外观;可溶性糖;有机酸;矿质营养;研究展望
-
木薯MeXYLP1基因的CRISPR/Cas9基因编辑载体构建及验证
作者:任思杨;毋志浩;王晓彤;张亚文;张兴龙;李瑞梅;姚远;郭建春;刘姣;胡新文
关键词:木薯(Manihot esculenta Crantz);基因编辑;载体构建;木质素
-
花生-玉米间作田东亚小花蝽对花生蚜的控制作用
作者:韦夕平;曲明静;陈瑶;鞠倩;李伟
关键词:东亚小花蝽;花生蚜;作物多样性;种群动态;肠道内含物;细胞色素氧化酶Ⅰ基因