紫苏甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因PfPMK的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李辉

作者： 李辉;温春秀;刘灵娣;温赛群;唐映红;姜涛

作者机构：

关键词： 紫苏;PfPMK;萜类;生物信息学;功能分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2022 年 37 卷 002 期

页码： 49-55

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究甲羟戊酸-5-磷酸激酶(PMK)在紫苏萜类物质生物合成代谢通路中的重要作用,对紫苏转录组数据进行分析,挖掘出紫苏PMK基因参考序列,采用基因克隆技术从紫苏中克隆了PMK基因,利用生物信息学和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的方法对紫苏PMK基因进行了分析.结果表明,紫苏PMK基因开放阅读框(ORF)全长为1524 bp,编码507个氨基酸.生物信息学分析显示,PfPMK的分子质量为54.73 ku,等电点为5.20,为亲水蛋白;紫苏PfPMK氨基酸与SmPMK、SsPMK、SbPMK和PvPMK同源性较高,说明紫苏PfPMK蛋白在进化过程中保守性较强.亲缘关系分析显示,PfPMK与丹参和一串红的PMK亲缘关系很近,在线软件WoLF-PSORT预测PfPMK蛋白可能定位于质膜或内质网膜上.qRT-PCR结果表明,PfPMK基因在紫苏根、茎、叶中均有表达,在根中的表达量高于在叶和茎中的表达量;紫苏不同生长发育时期的qRT-PCR分析显示,PfPMK基因在9月中下旬表达量较高.首次从紫苏中克隆出PfPMK基因,生物信息学分析该基因属于甲羟戊酸-5-磷酸激酶基因,参与了紫苏萜类物质的生物合成.

分类号： S563.2

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