丹参SmWRKY33基因的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龚婷

作者： 龚婷;刘灵娣;温春秀;武玉翠;王升;万修福;孙亚倩;姜涛

作者机构：

关键词： 丹参;SmWRKY33基因;生物信息学;qRT-PCR;基因克隆

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2024 年 52 卷 003 期

页码： 53-60

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究WRKY33基因在丹参非生物胁迫中的作用机制,以白花丹参为试验材料,对丹参转录组数据进行分析,挖掘出丹参WRKY33基因参考序列并设计特异性引物,利用基因克隆技术从丹参中克隆出WRKY33基因的全长cDNA,命名为SmWRKY33.对SmWRKY33基因进行生物信息学分析,同时利用荧光定量方法探究SmWRKY33基因在逆境胁迫下的表达模式.结果表明,SmWRKY33基因核苷酸长度为1 635 bp,编码544个氨基酸.生物信息学分析显示,SmWRKY33基因的理论相对分子量为60 835.66,等电点为7.00,定位于细胞核,不存在跨膜区及信号肽,SmWRKY33蛋白为不稳定亲水蛋白.亲缘关系显示,SmWRKY33与紫苏、芝麻、白花泡桐的WRKY33亲缘关系较近.密码子偏好性分析得出拟南芥真核表达最适应丹参SmWRKY33基因的外源表达.qRT-PCR结果表明,SmWRKY33基因在低温、高温、PEG、NaCl等逆境胁迫诱导下具有不同的表达模式,其中低温、NaCl能显著诱导SmWRKY33基因的高表达,说明该基因对温度调节、盐胁迫较为敏感,猜测其参与温度、盐胁迫调控反应机制.本试验首次从丹参中克隆出SmWRKY33基因,探讨了该基因在丹参逆境胁迫下的作用机制,旨在为培育丹参的抗逆新品种提供参考基因.

分类号： S567.5+30.1

  • 相关文献

[1]巴西橡胶树HbRPW8基因克隆与表达分析. 官鑫,涂敏,蔡海滨,王云月,胡彦师,曾霞. 2022

[2]基于RNA-Seq挖掘桃低温应答相关基因的研究. 李小兰1,2,郝兰兰1,2,张帆1,王鸿1,2. 2022

[3]丹参SmDREB2A基因的克隆与抗盐功能鉴定. 欧阳艳飞,刘灵娣,孙亚倩,马建军,赵双印,姜涛. 2025

[4]辣椒AP2/ERF家族转录因子CaERF109的克隆和表达分析. 高升华,李宁,王飞,尹延旭,余楚英,焦春海,姚明华. 2019

[5]茶树冷诱导基因RAV的克隆与表达特性分析. 陈林波,李叶云,王琴,高永亮,江昌俊. 2010

[6]柔嫩艾美耳球虫真核起始因子5和5A基因的克隆表达及转录动态分析. 苟灵俏,龚振兴,于三科,殷昊,马雪婷,蔡建平,林青. 2014

[7]茶树抗逆相关基因ERF的克隆与表达特性分析. 陈林波,房超,王郁,李叶云,江昌俊,梁名志. 2011

[8]半矮生型桃F-box基因的克隆和表达特征分析. 王玉兰,鲁振华,王志强,牛良,崔国朝. 2013

[9]番茄SlCaM3、SlCaM4和SlCaM5基因的克隆及低温胁迫下的表达分析. 王鹏,田哲娟,赵雪芳,康忱,吴志明,李亚栋,黄冀楠. 2023

[10]核桃FRUITFULL(JrFUL)基因的克隆及表达分析. 王企,陈利娜,夏小丛,敬丹,李好先,骆翔,曹尚银. 2019

[11]斑节对虾GTF2H4基因的分子克隆及表达分析. 王艳,傅明骏,赵超,周发林,杨其彬,邱丽华. 2016

[12]柔嫩艾美耳球虫多肽:N-乙酰氨基半乳糖转移酶2的基因表达及转录动态分析. 刘晓丽,龚振兴,马雪婷,曲自刚,韩政岚,刘保红,袁如意,杨孝朴,蔡建平. 2017

[13]家蚕微孢子虫葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因(G6PDH)的克隆及表达特征分析. 齐静茹,尚瑞沙,张志林,陈红丽,张轶岭,沈中元. 2018

[14]甘蓝型油菜GPAT9基因克隆与生物信息学分析. 刘少锋,邬贤梦,官春云,熊兴华. 2016

[15]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016

[16]无芒隐子草SAMS1基因的克隆及干旱胁迫下的表达分析. 孔令芳,张吉宇,刘志鹏,王彦荣. 2013

[17]中华蜜蜂GABARAP基因克隆、生物信息学分析及原核表达载体的构建. 于慧敏,吴鹏杰,李南南,谭静,徐书法,武江利. 2022

[18]小麦逆境胁迫相关基因TaCBL7的克隆、生物信息学及表达特性分析. 龙翔宇,蒲至恩,郑科,刘泽厚. 2013

[19]无芒隐子草CsPEAMT基因克隆及表达特性分析. 段珍,张吉宇,狄红艳,霍雅馨. 2014

[20]烟草NtMYB44b转录因子基因克隆以及生物信息学和表达分析. 余婧,郭玉双,雷波,张孝廉,赵德刚. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序