丹参SmWRKY33基因的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龚婷

作者： 龚婷;刘灵娣;温春秀;武玉翠;王升;万修福;孙亚倩;姜涛

作者机构：

关键词： 丹参;SmWRKY33基因;生物信息学;qRT-PCR;基因克隆

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2024 年 52 卷 003 期

页码： 53-60

收录情况： 北大核心

摘要： 为了研究WRKY33基因在丹参非生物胁迫中的作用机制,以白花丹参为试验材料,对丹参转录组数据进行分析,挖掘出丹参WRKY33基因参考序列并设计特异性引物,利用基因克隆技术从丹参中克隆出WRKY33基因的全长cDNA,命名为SmWRKY33.对SmWRKY33基因进行生物信息学分析,同时利用荧光定量方法探究SmWRKY33基因在逆境胁迫下的表达模式.结果表明,SmWRKY33基因核苷酸长度为1 635 bp,编码544个氨基酸.生物信息学分析显示,SmWRKY33基因的理论相对分子量为60 835.66,等电点为7.00,定位于细胞核,不存在跨膜区及信号肽,SmWRKY33蛋白为不稳定亲水蛋白.亲缘关系显示,SmWRKY33与紫苏、芝麻、白花泡桐的WRKY33亲缘关系较近.密码子偏好性分析得出拟南芥真核表达最适应丹参SmWRKY33基因的外源表达.qRT-PCR结果表明,SmWRKY33基因在低温、高温、PEG、NaCl等逆境胁迫诱导下具有不同的表达模式,其中低温、NaCl能显著诱导SmWRKY33基因的高表达,说明该基因对温度调节、盐胁迫较为敏感,猜测其参与温度、盐胁迫调控反应机制.本试验首次从丹参中克隆出SmWRKY33基因,探讨了该基因在丹参逆境胁迫下的作用机制,旨在为培育丹参的抗逆新品种提供参考基因.

分类号： S567.5+30.1

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