高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒山西分离株的鉴定及部分Nsp2基因序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴忻

作者： 吴忻;韩一超;王娟萍;刘文俊;姚敬明;孟帆;武守艳;雷宇平;陈剑波;樊振华;米瑞娟

作者机构：

关键词： 高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒;分离与鉴定;Nsp2基因;序列分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2012 年 39 卷 07 期

页码： 47-52

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究采集山西省不同地区的发病猪脏器组织与血液样品,采用特异性RT-PCR方法检测高致病性猪繁殖与呼吸综合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)样品16份,应用设计的特异性引物扩增出Nsp2基因序列,利用DNAStar生物信息学分析软件,对获得的序列与国外代表毒株VR-2332、国内代表毒株CH-1a、BJ-4、HB-1及PRRSV变异毒株HuN4和JXA1的序列进行了比较,绘制系统发生树。氨基酸序列比较分析发现山西省流行毒株同源性分别在69.8%～71.7%、85.3%～87.9%、68.7%～70.6%、91.7%～94.3%、94.3%～98.5%、95.1%～98.9%。所获得的16株病毒之间的同源性在90.9%～100%之间。研究结果发现所获得的序列同源性与国内近几年流行的PRRSV的变异毒株HuN4和JXA1毒株的序列同源性最高,分别在94.3%～98.5%与95.1%～98.9%之间,Nsp2基因缺失位置一致,其Nsp2均有2个部位出现了缺失,即Nsp2基因分别为编码1个氨基酸的3个核苷酸的缺失和编码29个氨基酸的连续87个核苷酸的缺失,结果表明,山西省目前流行PRRSV的变异毒株与国内流行株属于同一分支。

分类号： S852.65

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