基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发
文献类型: 中文期刊
第一作者: 秦桢
作者: 秦桢;王庆美;李爱贤;周媛媛;解备涛;段文学;张海燕;李广华;董顺旭;侯夫云
作者机构:
关键词: 甘薯;贮藏根;淀粉含量;单核苷酸多态性标记;转录组分析
期刊名称: 山东农业科学
ISSN: 1001-4942
年卷期: 2024 年 56 卷 012 期
页码: 10-15
摘要: 甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯徐薯8号和低淀粉品种郑薯20及其杂交F1代中6个高淀粉株系和6个低淀粉株系为材料,基于转录组测序分析并结合表型分析,发现44个高淀粉特异的SNPs位点,从中选取9个进行PCR单克隆分析,筛选到3个与高淀粉含量显著相关的位点,分别为chr9.27120209、chr9.27120256和chr9.13675504,用上述12个株系和F1群体中的另外16个株系进行验证,最终得到3个与贮藏根淀粉含量相关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。本试验丰富了甘薯分子标记开发的途径,为甘薯贮藏根淀粉含量相关育种提供了可选择的标记。
分类号: S531
- 相关文献
[1]根系功能分离技术在甘薯源库关系研究中的演进及其应用. 李明,梁永书,张聪,屈会娟,刘敏悦,黄丹,杨舒雅,彭梅芳. 2024
[2]影响甘薯出粉率因素的初步研究. 刘文静,潘葳,余华. 2010
[3]施肥量、栽插期及密度对"渝薯27"产量及淀粉含量的影响. 程国平,赵继献,杨顺国,傅玉凡,蔡余洪,郎贵英. 2022
[4]甘薯SRAP连锁图构建淀粉含量QTL检测. 谭文芳,何俊蓉,蒲志刚,王大一,张正圣,詹付凤,阎文昭. 2005
[5]施钾时期对甘薯济徐23块根淀粉积累与品质的影响及酶学生理机制. 柳洪鹃,姚海兰,史春余,张立明. 2014
[6]木薯作物遗传资源、生物技术与育种. Luiz JCB Carvalho,陈松笔. 2020
[7]中华鳖MyoD1基因SNP鉴定及其与生长性状的关联分析. 黄龙,吴本丽,何吉祥,陈静,宋光同,汪翔,张烨,武松. 2019
[8]甘蓝型油菜种子和角果皮中硫苷含量的动态变化及转录组关联分析. 田志涛,赵永国,LENKA Havlickova,HE Zhesi,REA L Harper,IAN Bancroft,邹锡玲,张学昆,陆光远. 2018
[9]利用双向导入系剖析水稻源、库相关性状的QTL. 张强,陈凯,梁云涛,章禄标,郑天清,徐建龙,张文忠,黎志康. 2013
[10]基于基因组重测序发掘金针菇InDel、SV及丰度SNP标记. 贾定洪,王波,何晓兰,刘询. 2024
[11]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015
[12]旱柳转录组测序及生物学分析. 李敏,郭聪,李玉娟,冯新民,王莹,张健,谈峰. 2019
[13]玉米矮秆突变体A2的表型鉴定及转录组分析. 董春林,翟广谦,张正,杨睿,张明义,张彦琴,杨丽莉,常建忠. 2019
[14]基于转录组挖掘蕉城苦茶苦茶碱合成相关基因. 陈潇敏,王鹏杰,王淑燕,杨如兴,孙君,郭永春,陈雪津,赵峰,叶乃兴. 2021
[15]基于转录组测序的金柑类黄酮糖基转移酶基因的初步分析. 谭嫣,马小迪,王久照,刘小刚,曾明. 2019
[16]'枸头'橙针刺和枝的转录组分析. 孙立方,柯甫志,聂振朋,王平,孙建华,黄秀,徐建国. 2020
[17]肇实转录组测序及生物信息学分析 被引量:1. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019
[18]肇实转录组测序及生物信息学分析. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019
[19]脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析. 沈晔,王兴强,曹梅,郑年昊,陈百尧,秦传新. 2020
[20]脊尾白虾对低氧响应的转录组学分析. 曹梅,王兴强,秦传新,沈晔,张子杨,钱诗悦. 2021
作者其他论文 更多>>
-
沙棘玫瑰醋高产酸菌株的分离和筛选及分子生物学鉴定
作者:张海燕;康三江;陈志玺;袁晶;苟丽娜
关键词:沙棘玫瑰醋;醋酸杆菌;高产酸;分离筛选;菌种鉴定
-
花生颈腐病菌Diplodia gossypina全基因组序列资源(英文)
作者:王振宇;冯兰兰;高蒙;王娜;李绍建;范腕腕;崔小伟;桑素玲;张海燕
关键词:花生;颈腐病;棉色二孢;基因组测序分析;效应蛋白;SNF1
-
苹果-沙棘复合饮品益生菌发酵工艺优化研究
作者:袁晶;康三江;张海燕;苟丽娜;宋娟
关键词:益生菌;发酵;苹果-沙棘汁;工艺优化
-
花生白绢病拮抗细菌的分离鉴定及其生防作用研究
作者:范腕腕;王振宇;张海燕;崔小伟;冯兰兰;高蒙
关键词:花生白绢病;齐整小核菌;贝莱斯芽胞杆菌YJ02;生物防治
-
不同菌种发酵苹果酵素抗氧化性的动态变化及其品质研究
作者:张海燕;康三江;袁晶;苟丽娜;宋娟
关键词:苹果酵素;抗氧化性;品质;不同菌种;自由基清除能力
-
25份纤用工业大麻种质资源的筛选与综合评价
作者:张雪;安仕博;张海燕;韩祉君;赵丹琪;凤桐;于翠香;赵福顺;肖靖;徐瑞
关键词:工业大麻;资源;筛选;综合评价
-
油莎豆组织培养和快速繁殖技术研究
作者:程艳;张海燕;张健;刘佳遥;魏尊苗;金羽琨;钱雪艳;齐高娃;李红岩;于世超
关键词:油莎豆;组织培养;再生体系;正交试验;生根
