基于转录组分析的甘薯贮藏根淀粉含量相关SNPs开发

文献类型: 中文期刊

第一作者: 秦桢

作者: 秦桢;王庆美;李爱贤;周媛媛;解备涛;段文学;张海燕;李广华;董顺旭;侯夫云

作者机构:

关键词: 甘薯;贮藏根;淀粉含量;单核苷酸多态性标记;转录组分析

期刊名称: 山东农业科学

ISSN: 1001-4942

年卷期: 2024 年 56 卷 012 期

页码: 10-15

摘要: 甘薯是重要的粮食和经济作物,贮藏根淀粉含量是甘薯的重要农艺性状,开发与淀粉含量相关的分子标记对于加快育种进程具有重要意义。但甘薯具有自交不亲和特性,基因组是高度杂合的六倍体,增加了开发分子标记的难度。本试验以高淀粉品种漯徐薯8号和低淀粉品种郑薯20及其杂交F1代中6个高淀粉株系和6个低淀粉株系为材料,基于转录组测序分析并结合表型分析,发现44个高淀粉特异的SNPs位点,从中选取9个进行PCR单克隆分析,筛选到3个与高淀粉含量显著相关的位点,分别为chr9.27120209、chr9.27120256和chr9.13675504,用上述12个株系和F1群体中的另外16个株系进行验证,最终得到3个与贮藏根淀粉含量相关的单核苷酸多态性(SNPs)位点。本试验丰富了甘薯分子标记开发的途径,为甘薯贮藏根淀粉含量相关育种提供了可选择的标记。

分类号: S531

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