草鱼天然抗性相关巨噬蛋白基因全长cDNA的克隆与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 范玉顶
作者: 范玉顶;徐进;罗晓松;周勇;肖艺;曾令兵
作者机构:
关键词: 草鱼;天然抗性巨噬蛋白基因(Nramp);cDNA;表达;RT-PCR;RACE
期刊名称: 中国水产科学
ISSN: 1005-8737
年卷期: 2011 年 18 卷 01 期
页码: 38-47
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)家族是一类抑制胞内寄生菌侵染的天然免疫相关蛋白。本研究克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Nramp基因并进行了表达分析。该基因cDNA序列全长为3 158 bp,编码1个含544个氨基酸的蛋白。该蛋白含有Nramp家族的特征序列:包含12个跨膜区(TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运结构域(CTM)。草鱼Nramp同其他16个物种的Nramp氨基酸序列同源性在62.5%~90.2%之间。草鱼Nramp基因cDNA的独特结构是其3′末端非翻译区(UTR)和5′UTR各有1个脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(IRE)。系统进化分析表明,草鱼Nramp和所有鱼类Nramp聚为一簇,与哺乳类Nramp2的亲缘关系较近。Nramp基因在草鱼头肾和脾脏中的表达量最高,在肌肉和皮肤中的表达量最低,在草鱼呼肠孤病毒(GCRV)感染的草鱼肾脏细胞系(CIK)中的表达量明显升高。
分类号: S917.4
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